-
Single-nucleus RNA Sequencing
De foarútgong yn it fêstlizzen fan ien sel en technyk foar yndividuele bibleteekbou, kombineare mei sequencing mei hege trochput, makket geneekspresjestúdzjes mooglik op sel-foar-sel basis.It makket in djippere en folsleine systeemanalyse mooglik op komplekse selpopulaasjes, wêryn it foar in grut part maskering fan har heterogeniteit foarkomt troch it gemiddelde fan alle sellen te nimmen.
Guon sellen binne lykwols net geskikt om te wurde makke yn ien-sel-suspensie, dus oare metoaden foar tarieding fan monsters - kearnekstraksje út weefsels binne nedich, dat is, kearn wurdt direkt ekstrahearre út weefsels as sel en taret yn ienkearnsuspensje foar single- sel sequencing.
BMK jout 10 × Genomics Chromium TM basearre single-cell RNA sequencing tsjinst.Dizze tsjinst is in protte brûkt yn stúdzjes oer sykte-relatearre stúdzjes, lykas differinsjaasje fan ymmúnsellen, tumorheterogeniteit, weefselûntwikkeling, ensfh.
Romtlike transkriptoomchip: 10 × Genomics
Platfoarm: Illumina NovaSeq Platfoarm
-
Plant / Animal Whole Genome Sequencing
Folsleine genome-re-sekwinsje, ek wol WGS neamd, makket it iepenbierjen fan sawol mienskiplike as seldsume mutaasjes op it heule genom mooglik, ynklusyf Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Insertion Deletion (InDel), Structure Variation (SV), en Copy Number Variation (CNV) ).SV's meitsje in grutter diel fan 'e fariaasjebasis út as SNP's en hawwe in gruttere ynfloed op it genoom, wat in signifikant effekt hat op libbene organismen.Langlêzen resequencing soarget foar krekter identifikaasje fan grutte fragminten en yngewikkelde fariaasjes, om't lange lêzings it folle makliker meitsje om chromosomale krusing oer yngewikkelde regio's lykas tandem-repetysjes, GC / AT-rike regio's, en hyper-fariabele regio's.
Platfoarm: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Romtlike transkriptoom
Romtlike transkriptomika stiet oan 'e foargrûn fan wittenskiplike ynnovaasje, en stelt ûndersikers yn steat om te ferdjipjen yn yngewikkelde gen-ekspresjepatroanen binnen weefsels, wylst se har romtlike kontekst behâlde.Te midden fan ferskate platfoarms hat BMKGene de BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip ûntwikkele, mei inferbettere resolúsjefan 5µM, it berikken fan it subcellulêre berik, en ynskeakeljemulti-nivo resolúsje ynstellings.De S1000-chip, mei sawat 2 miljoen spots, brûkt mikrowellen lein mei kralen laden mei romtlik barcodearre capture probes.In cDNA-bibleteek, ferrike mei romtlike barcodes, wurdt taret fan 'e S1000-chip en dêrnei sequearre op it Illumina NovaSeq-platfoarm.De kombinaasje fan romtlik barcodeare samples en UMI's soarget foar de krektens en spesifisiteit fan 'e generearre gegevens.It unike attribút fan 'e BMKManu S1000-chip leit yn syn veelzijdigheid, en biedt resolúsje-ynstellingen op meardere nivo's dy't fyn kinne wurde ôfstimd op ferskate weefsels en nivo's fan detail.Dizze oanpassingsfermogen posearret de chip as in treflike kar foar ferskate romtlike transkriptomika-stúdzjes, en soarget foar krekte romtlike klustering mei minimaal lûd.
Mei it brûken fan de BMKManu S1000-chip en oare romtlike transkriptomyske technologyen kinne ûndersikers in better begryp krije fan 'e romtlike organisaasje fan sellen en de komplekse molekulêre ynteraksjes dy't binnen weefsels foarkomme, en jouwe ûnskatbere ynsjoch yn 'e meganismen dy't ûnderlizzende biologyske prosessen yn in breed skala oan fjilden, ynklusyf onkology, neuroscience, ûntwikkelingsbiology, immunology en botanyske stúdzjes.
Platfoarm: BMKManu S1000-chip en Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Romtlike transkriptoom
Romtlike transkriptomika is in moderne technology wêrmei ûndersikers genekspresjepatroanen binnen weefsels kinne ûndersykje, wylst se har romtlike kontekst behâlde.Ien krêftich platfoarm yn dit domein is 10x Genomics Visium keppele mei Illumina-sequencing.It prinsipe fan 10X Visium leit op in spesjalisearre chip mei in oanwiisd fangen gebiet dêr't weefsel seksjes wurde pleatst.Dit fangen gebiet befettet barcoded spots, elk oerienkomt mei in unike romtlike lokaasje binnen it weefsel.De fongen RNA-molekulen út it weefsel wurde dan markearre mei unike molekulêre identifiers (UMI's) tidens it omkearde transkripsjeproses.Dizze barcoded spots en UMI's meitsje sekuere romtlike mapping en kwantifikaasje fan geneekspresje mooglik by in resolúsje fan ien sel.De kombinaasje fan romtlik barcodearre samples en UMI's soarget foar de krektens en spesifisiteit fan 'e generearre gegevens.Troch dizze Spatial Transcriptomics-technology te brûken, kinne ûndersikers in djipper begryp krije fan 'e romtlike organisaasje fan sellen en de komplekse molekulêre ynteraksjes dy't foarkomme yn weefsels, en biede ûnskatbere ynsjoch yn' e meganismen dy't ûnderlizzende biologyske prosessen yn meardere fjilden, ynklusyf onkology, neurowittenskip, ûntwikkelingsbiology, immunology , en botanyske stúdzjes.
Platfoarm: 10X Genomics Visium en Illumina NovaSeq
-
Full-Length mRNA Sequencing-Nanopore
Wylst NGS-basearre mRNA-sekwinsje tsjinnet as in alsidich ark foar kwantifikaasje fan geneekspresje, beheint har ôfhinklikens fan koarte lêzings syn effektiviteit yn komplekse transkriptomyske analyzes.Nanopore sequencing, oan 'e oare kant, brûkt langlêzen technology, wêrtroch't de sequencing fan mRNA-transkripten fan folsleine lingte mooglik is.Dizze oanpak fasilitearret in wiidweidige ferkenning fan alternative splicing, gen-fúzjes, poly-adenylaasje, en de kwantifikaasje fan mRNA isofoarmen.
Nanopore sequencing fertrout op nanopore single-molecule real-time elektryske sinjalen.Begeliede troch motorproteinen, bindet dûbelstrings DNA oan nanoporeproteinen ynbêde yn in biofilm, en ûntwikkelt as it troch it nanoporekanaal giet ûnder in spanningsferskil.De ûnderskate elektryske sinjalen generearre troch ferskate basen op 'e DNA-string wurde ûntdutsen en klassifisearre yn real-time, it fasilitearjen fan krekte en trochgeande nukleotide-sekwinsje.Dizze ynnovative oanpak oerwint beheiningen foar koarte lêzen en leveret in dynamysk platfoarm foar yngewikkelde genomyske analyse, omfettet komplekse transkriptomyske stúdzjes.
Platfoarm: Nanopore Promethion P48
-
Folsleine lingte mRNA sequencing -PacBio
Wylst op NGS-basearre mRNA-sekwinsjes in alsidige ark is foar it kwantifisearjen fan gen-ekspresje, beheint har ôfhinklikens fan koarte lêzings it gebrûk yn komplekse transkriptomyske analyzes.PacBio sequencing (Iso-Seq), oan 'e oare kant, brûkt langlêzen technology, wêrtroch't de sequencing fan mRNA-transkripten fan folsleine lingte mooglik is.Dizze oanpak fasilitearret in wiidweidige ferkenning fan alternative splicing, gen-fúzjes en poly-adenylaasje, hoewol it net de primêre kar is foar kwantifikaasje fan geneekspresje, fanwegen de hege hoemannichte gegevens nedich.
PacBio sequencing technology fertrout op single-molecule, real-time (SMRT) sequencing, it leverjen fan in dúdlik foardiel yn it fêstlizzen fan folsleine mRNA-transkrippen.Dizze ynnovative oanpak omfettet it brûken fan nul-modus waveguides (ZMW's), mikrofabrisearre putten dy't de real-time observaasje fan DNA-polymerase-aktiviteit ynskeakelje tidens sequencing.Binnen dizze ZMW's syntetisearret PacBio's DNA-polymerase in komplemintêre DNA-streng, en genereart lange lêzings dy't it gehiel fan mRNA-transkrippen oerspant.PacBio-operaasje yn Circular Consensus Sequencing (CCS) modus ferbettert de krektens troch ferskate kearen sequencing itselde molekule.De generearre HiFi-lêzen hawwe in krektens fergelykber mei NGS, en drage fierder by oan in wiidweidige en betroubere analyze fan komplekse transkriptomyske funksjes.Platfoarm: PacBio Sequel II
-
Eukaryotic mRNA Sequencing-Illumina
mRNA-sekwinsje makket de wiidweidige profilearring fan alle mRNA-transkrippen binnen sellen ûnder spesifike omstannichheden mooglik.Dizze avansearre technology tsjinnet as in krêftich ark, ûntbleatet yngewikkelde gene-ekspresjeprofilen, genstruktueren en molekulêre meganismen ferbûn mei ferskate biologyske prosessen.In soad oannommen yn fûnemintele ûndersyk, klinyske diagnoaze, en medisynûntwikkeling, mRNA-sekwinsje biedt ynsjoch yn 'e yngewikkeldheden fan sellulêre dynamyk en genetyske regeljouwing.
Platfoarm: Illumina NovaSeq X
-
Non-Reference based mRNA Sequencing-Illumina
mRNA-sekwinsje makket de wiidweidige profilearring fan alle mRNA-transkrippen binnen sellen ûnder spesifike omstannichheden mooglik.Dizze avansearre technology tsjinnet as in krêftich ark, ûntbleatet yngewikkelde gene-ekspresjeprofilen, genstruktueren en molekulêre meganismen ferbûn mei ferskate biologyske prosessen.In soad oannommen yn fûnemintele ûndersyk, klinyske diagnoaze, en medisynûntwikkeling, mRNA-sekwinsje biedt ynsjoch yn 'e yngewikkeldheden fan sellulêre dynamyk en genetyske regeljouwing.
Platfoarm: Illumina NovaSeq X
-
Lange net-kodearjen sequencing-Illumina
Lange net-kodearjende RNA's (lncRNA's) binne RNA's langer dan 200 nukleotiden dy't minimaal kodearjen potinsjeel hawwe en pivotale eleminten binne binnen net-kodearjend RNA.Fûn yn 'e kearn en cytoplasma, spylje dizze RNA's krúsjale rollen yn epigenetyske, transkripsjonele en post-transkripsjonele regeling, en ûnderstreekje har betsjutting yn it foarmjen fan sellulêre en molekulêre prosessen.LncRNA-sekwinsje is in krêftich ark yn selledifferinsjaasje, ontogenesis, en minsklike sykten.
Platfoarm: Illumina NovaSeq
-
Lytse RNA-sequencing-Illumina
Lytse RNA (sRNA) molekulen, typysk ûnder 200 nukleotiden yn 'e lingte, omfetsje mikroRNA's (miRNA's), lytse ynterferearjende RNA's (siRNA's), en piwi-ynteraksjende RNA's (piRNA's).Under dizze binne miRNA's, sawat 20-24 nukleotiden lang, benammen opmerklik foar har pivotale regeljende rollen yn ferskate sellulêre prosessen.Mei weefsel-spesifike en poadium-spesifike ekspresjepatroanen, miRNA's eksposearje hege behâld oer ferskate soarten.
Platfoarm: Illumina NovaSeq
-
circRNA sequencing-Illumina
Sirkulêre RNA-sekwinsje (circRNA-seq) is om sirkulêre RNA's te profilearjen en te analysearjen, in klasse fan RNA-molekulen dy't sletten loops foarmje fanwege net-kanonike splicing-eveneminten, dy't dizze RNA mei ferhege stabiliteit leverje.Wylst guon circRNAs binne oantoand te fungearjen as microRNA-sponzen, sequestering microRNAs en foarkommen dat se har doel-mRNA's regelje, kinne oare circRNA's ynteraksje mei aaiwiten, moduleare gene-ekspresje, of rollen hawwe yn sellulêre prosessen.circRNA-ekspresje-analyse jout ynsjoch yn 'e regeljende rollen fan dizze molekulen en har betsjutting yn ferskate sellulêre prosessen, ûntwikkelingsstadia en syktebetingsten, en draacht by oan in djipper begryp fan' e kompleksiteit fan RNA-regeling yn 'e kontekst fan geneekspresje.
-
Folsleine transkriptome-sekwinsje - Illumina
Folsleine transkriptoomsekwinsje biedt in wiidweidige oanpak foar it profilearjen fan ferskate RNA-molekulen, en omfettet sawol kodearjen (mRNA) as net-kodearjende RNA's (lncRNA, circRNA, en miRNA).Dizze technyk vangt it folsleine transkriptoom fan spesifike sellen op in bepaald momint, wêrtroch in holistysk begryp fan sellulêre prosessen mooglik is.Ek bekend as "totale RNA-sekwinsje", is it as doel om yngewikkelde regeljouwingsnetwurken te ûntbleatsjen op it transkriptoomnivo, wêrtroch djippe analyse mooglik is, lykas konkurrearjende endogene RNA (ceRNA) en mienskiplike RNA-analyse.Dit markearret de inisjele stap nei funksjonele karakterisearring, benammen yn it unraveljen fan de regeljouwing netwurken wêrby't circRNA-miRNA-mRNA-basearre ceRNA-ynteraksjes.
