-
PacBio-folsleine 16S/18S/ITS Amplicon Sequencing
Amplicon (16S / 18S / ITS) platfoarm is ûntwikkele mei jierrenlange ûnderfining yn mikrobieel ferskaat projektanalyse, dy't standerdisearre basisanalyse en personaliseare analyse befettet: basisanalyse beslacht de mainstream-analyze-ynhâld fan hjoeddeistige mikrobieel ûndersyk, de analyse-ynhâld is ryk en wiidweidich, en analyseresultaten wurde presintearre yn 'e foarm fan projektrapporten;De ynhâld fan personaliseare analyze is ferskaat.Samples kinne wurde selekteare en parameters kinne fleksibel ynsteld wurde neffens it basisanalyserapport en ûndersyksdoel, om personaliseare easken te realisearjen.Windows bestjoeringssysteem, ienfâldich en fluch.
-
PacBio-folsleine transkriptoom (net-referinsje)
Troch Pacific Biosciences (PacBio) Isoform-sekwinsjegegevens as ynfier te nimmen, is dizze app yn steat om transkripsjesekwinsjes fan folsleine lingte te identifisearjen (sûnder gearstalling).Troch sekwinsjes fan folsleine lingte yn kaart te bringen tsjin referinsjegenoom, kinne transkripsjes optimalisearre wurde troch bekende genen, transkripsjes, kodearringregio's, ensfh. Yn dit gefal kin krektere identifikaasje fan mRNA-struktueren, lykas alternative splicing, ensfh.Mienskiplike analyze mei NGS-transkriptom-sekwinsjegegevens makket wiidweidigere annotaasje en krekter kwantifikaasje yn ekspresje op transkripsjenivo mooglik, wat foar in grut part profitearret downstream differinsjaal ekspresje en funksjonele analyse.
-
Toolkits
BMKCloud is in liedend bioinformatysk platfoarm dat ien-stop-oplossing leveret foar genomyske programma's, dat breed fertroud wurdt troch ûndersikers yn ferskate arena's ynklusyf medyske, agraryske, miljeu, ensfh. , komputerboarnen, iepenbiere databank, bioinformatyske online kursussen, ensfh. BMKCloud hat ferskate faak brûkte bioinformatyske ark fan ynklusyf geneannotaasje, evolúsjonêre genetyske ark, ncRNA, gegevenskwaliteitskontrôle, gearstalling, ôfstimming, dataekstraksje, mutaasjes, statistiken, figuergenerator, folchoarder analyze, ensfh.
-
lytse RNA
Lytse RNA's binne soarte fan koarte net-kodearjende RNA mei gemiddelde lingte fan 18-30 nt, ynklusyf miRNA, siRNA en piRNA.Dizze lytse RNA's binne massaal rapportearre om belutsen te wêzen by ferskate biologyske prosessen lykas mRNA-degradaasje, oersetsinhibysje, heterochromatinefoarming, ensfh. SmallRNA-sequencing-analyze is breed tapast yn stúdzjes oer dier-/plantûntwikkeling, sykte, firus, ensfh. sequencing analyse platfoarm bestiet út standert analyze en avansearre data mining.Op basis fan RNA-seq-gegevens kin standertanalyse miRNA-identifikaasje en foarsizzing, miRNA-doelgenfoarsizzing, annotaasje en ekspresjeanalyse berikke.Avansearre analyse makket it mooglik om oanpaste miRNA sykjen en ekstraksje, Venn diagram generaasje, miRNA en doelgenen netwurk gebou.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS is in hiele genome re-sequencing analyse platfoarm, dat is ûntwikkele op basis fan rike ûnderfining yn Biomarker Technologies.Dit maklik te brûken platfoarm makket it rappe yntsjinjen fan in yntegreare analyseworkflow mooglik troch gewoan in pear basisparameter yn te stellen, dy't past foar DNA-sekwinsjegegevens generearre fan sawol Illumina-platfoarm as BGI-sekwinsjeplatfoarm.Dit platfoarm wurdt ynset op hege prestaasjes komputerserver, dy't heul effisjinte gegevensanalyse yn heul beheinde tiid mooglik makket.Persoanlike mining fan gegevens is beskikber op basis fan standertanalyse, ynklusyf mutearre genfraach, PCR-primerûntwerp, ensfh.
-
mRNA (Referinsje)
Transkriptoom is de ferbining tusken genomyske genetyske ynformaasje en it proteoom fan biologyske funksje.Regulearring fan transkripsjenivo is de wichtichste en de meast studearre regeljouwingsmodus fan organismen.Transkriptoom-sekwinsje kin it transkriptoom op elk punt yn 'e tiid of ûnder elke betingst folje, mei in resolúsje krekt foar ien nukleotide. sample spesifike transkripsjes.
Op it stuit is technology foar transkriptoomsekwinsjes in protte brûkt yn agronomy, medisinen en oare ûndersyksfjilden, ynklusyf regeljouwing foar dier- en plantûntwikkeling, miljeu-oanpassing, ymmuninteraksje, genlokalisaasje, genetyske evolúsje fan soarten en deteksje fan tumors en genetyske sykten.
-
Metagenomics (NGS)
Dit analyseplatfoarm is ûntworpen foar metagenomyske gegevensanalyse op basis fan jierrenlange ûnderfining.It bestiet út in yntegreare workflow dy't ferskate fan 'e algemien needsaaklike metagenomika-analyzes befettet, ynklusyf gegevensferwurking, stúdzjes op soartenivo, stúdzjes op genfunksjenivo, metagenoombinning, ensfh. Dêrneist binne oanpaste ark foar data mining beskikber op standert analyseworkflow, ynklusyf gene- en soartenfraachfraach. , parameter ynstelling, personaliseare figuer generearjen, ensfh.
-
LncRNA
Lange net-kodearjende RNA's (lncRNA) binne in soarte fan transkripsjes mei lingte langer dan 200 nt, dy't net yn steat binne om aaiwiten te kodearjen.Akkumulatyf bewiis suggerearret dat de measte lncRNA's heul wierskynlik funksjoneel binne.Sequencingtechnologyen mei hege trochset en ark foar bioinformatyske analysearjen jouwe ús yn steat om lncRNA-sekwinsjes te iepenbierjen en ynformaasje effisjinter te pleatsen en ús te lieden om lncRNA's te ûntdekken mei krúsjale regeljouwingsfunksjes.BMKCloud is grutsk om ús klanten lncRNA-sequencing-analyseplatfoarm te leverjen om rappe, betroubere en fleksibele lncRNA-analyse te berikken.
-
GWAS
Genome-wide association study (GWAS) hat as doel om genetyske farianten (genotype) te identifisearjen dy't ferbûn binne mei spesifike eigenskippen (fenotype).GWA-stúdzjes ûndersiket genetyske markers troch it heule genom fan in grut oantal yndividuen en foarsizze genotyp-fenotypeferienings troch statistyske analyze op populaasjenivo.Folsleine-genoom-resequencing kin mooglik alle genetyske farianten ûntdekke.Keppeling mei fenotypyske gegevens, GWAS kin wurde ferwurke om fenotype-relatearre SNP's, QTL's en kandidaatgenen te identifisearjen, dy't de moderne dier-/plantefokkerij sterk stipet.SLAF is in sels-ûntwikkele ferienfâldige genome sequencing strategy, dy't ûntdekt genome-wide ferdield markers, SNP.Dizze SNP's, as molekulêre genetyske markers, kinne wurde ferwurke foar assosjaasjestúdzjes mei rjochte eigenskippen.It is in kosten-effektive strategy by it identifisearjen fan komplekse eigenskippen assosjearre genetyske fariaasjes.
-
Nanopore Transkriptomika fan folsleine lingte
Komplekse en fariabele alternative isofoarmen yn organismen binne wichtige genetyske meganismen foar it regulearjen fan gen-ekspresje en proteïnferskaat.Accurate identifikaasje fan transkripsjestruktueren is de basis foar yngeande stúdzje fan genekspresjeregulaasjepatroanen.Nanopore sequencing platfoarm hat transkriptomyske stúdzje mei súkses brocht nei isoform-nivo.Dit analyseplatfoarm is ûntworpen om RNA-Seq-gegevens te analysearjen generearre op Nanopore-platfoarm op basis fan referinsjegenoom, dy't kwalitative en kwantitative analyzes berikke op sawol gennivo as transkripsjenivo.
-
circ-RNA
Circular RNA (circRNA) is in soarte fan net-kodearjende RNA, dy't koartlyn fûn in fitale rol te spyljen yn regeljouwing netwurken belutsen by ûntwikkeling, miljeu ferset, ensfh úteinen fan circRNA wurde gearfoege om in sirkelfoarmige struktuer te foarmjen, dy't har bewarje fan fersmoarging fan exonuklease en stabiler binne as de measte lineêre RNA.CircRNA is fûn om ferskate funksjes te hawwen by it regulearjen fan gen-ekspresje.CircRNA kin prestearje as ceRNA, dy't miRNA kompetitive bynt, bekend as miRNA-spons.CircRNA-sequencing-analyseplatfoarm makket circRNA-struktuer- en ekspresjeanalyse, doelfoarsizzing en mienskiplike analyze mei oare soarten RNA-molekulen mooglik.
-
BSA
Bulked Segregant Analysis platfoarm bestiet út ien-stap standert analyze en avansearre analyse mei oanpaste parameter ynstelling.BSA is in technyk brûkt om fluch identifisearje fenotype assosjearre genetyske markers.Main workflow fan BSA befettet: 1. selektearje twa groepen fan yndividuen mei ekstreem tsjinoerstelde fenotypen;2. it sammeljen fan it DNA, RNA of SLAF-seq (ûntwikkele troch Biomarker) fan alle yndividuen om twa bulk fan DNA te foarmjen;3. it identifisearjen fan differinsjaal sekwinsjes tsjin referinsjegenoom of yn tusken, 4. foarsizze fan kandidaat-keppele regio's troch ED en SNP-yndeks algoritme;5. Funksjonele analyze en ferriking op genen yn kandidaatregio's, ensfh. Mear avansearre mining yn gegevens ynklusyf genetyske marker-screening en primer-ûntwerp binne ek beskikber.
