GENOME
Chromosome-skaal gearstalling en analyze fan biomassa gewaaks Miscanthus lutarioriparius genoom
Nanopore sequencing |Illumina |Hi-C |RNA-sequencing |Fylogeny
Yn dizze stúdzje levere Biomarker Technologies technyske stipe oer Nanopore-sekwinsjes, de novo genome-assemblage, Hi-C assistearre assemblage, ensfh.
Abstrakt
Miscanthus, in rhizomatous perennial plant, hat grutte mooglikheden foar bioenergy produksje foar syn hege biomassa en stress tolerânsje.Wy melde in chromosome-skaal gearstalling fanMiscanthus lutarioripariusgenome troch it kombinearjen fan Oxford Nanopore sequencing en Hi-C technologyen.De 2.07-Gb-gearkomste beslacht 96.64% fan it genoom, mei contig N50 fan 1.71 Mb.De centromere- en telomere-sekwinsjes wurde gearstald foar respektivelik alle 19 chromosomen en chromosoom 10.Allotetraploide oarsprong fan 'e M. lutarioriparius wurdt befêstige mei help fan sintromearyske satellytwerhellingen.De tetraploide genoomstruktuer en ferskate chromosomale weryndielingen relatyf oan sorghum wurde dúdlik oantoand.Tandem duplicate genen fanM. lutarioripariusbinne funksjoneel ferrike net allinnich yn termen yn ferbân mei stress reaksje, mar sel muorre biosynteze.Genfamyljes dy't relatearre binne oan sykteresistinsje, biosynteze fan selmuorre en ferfier fan metalen binne sterk útwreide en evoluearre.De útwreiding fan dizze famyljes kin in wichtige genomyske basis wêze foar it ferbetterjen fan opmerklike eigenskippen fanM. lutarioriparius.
Key statistiken fan genome gearstalling
Stal.Oersjoch fan de M. lutarioriparius genome gearkomste
Nijs en hichtepunten is fan doel de lêste suksesfolle gefallen te dielen mei Biomarker Technologies, it fêstlizzen fan nije wittenskiplike prestaasjes lykas promininte techniken tapast tidens de stúdzje.
Post tiid: Jan-05-2022