BMKCloud Log in
条形banner-03

Products

Genome-wide Association Analysis

Genome-wide association study (GWAS) hat as doel om genetyske farianten (genotype) te identifisearjen dy't ferbûn binne mei spesifike eigenskippen (fenotype).GWAS-stúdzje ûndersiket genetyske markers troch it heule genom fan in grut oantal yndividuen en foarseit genotyp-fenotypeferienings troch statistyske analyze op populaasjenivo.It is breed tapast yn ûndersyk nei minsklike sykten en funksjonele genmynbou op komplekse eigenskippen fan bisten of planten.


Service Details

Demo Resultaat

Featured Publication

byld 3

1.Service Foardielen

● Abundant Project Cases: sûnt syn oprjochting yn 2009, BMKGENE hat foltôge hûnderten soarten projekten yn populaasje GWAS ûndersyk, bystien ûndersikers te publisearjen mear as 100 artikels, en de kumulative ynfloed faktor berikt 500.
● Profesjonele analysts.
● Koarte analyze syklus.
● Accurate data mining.

2. Service Spesifikaasjes

Type

Befolkingskaal

Sequencing strategy en djipte

SLAF-GWAS Sample nûmer ≥200 Genoomgrutte <400M, mei ref-genoom, WGS wurdt oanrikkemandearre

Genome grutte ≤ 1G, 100K Tags en 10X

1G ≤ Genome grutte ≤ 2G, 200K tags en 10X

Genome grutte> 2G, 300K Tags en 10X

WGS-GWAS

Sample nûmer ≥200

10X foar elke stekproef

3. Materiaal Seleksje

动物1
动物2
byld7

Ferskillende fariëteiten, ûndersoarten, lânrassen / genbanken / mingde famyljes / wylde boarnen

Ferskillende soarten, ûndersoarten, lânrassen

Half-sib famylje / folsleine-sib famylje / wylde boarnen

4. Bioinformation Analysis

● Genome-wide assosjaasje analyze
● Analyse en screening fan signifikante SNP
● Funksjonele annotaasje fan kandidaatgen

5. Service Work Flow

Foarbyld fan QC

Eksperimint ûntwerp

sample levering

Sample levering

Pilot eksperimint

RNA-ekstraksje

Biblioteek Tarieding

Biblioteekbou

Sequencing

Sequencing

Data analyze

Data analyze

Nei ferkeap Tsjinsten

Nei-ferkeap tsjinsten


  • Foarige:
  • Folgjende:

  • in.Fenotype QC

    Frekwinsje distribúsje histogram

    ôfbylding9

    Fenotype statistiken

    ôfbylding10

    b.Assosiaasjeanalyse (Model: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)

    QQ plot

    ôfbylding11

    Manhattan Plot

    Ammoniak_emmax_manhattan_00

    Jier

    Sjoernaal

    IF

    Titel

    2022

    NC

    17.69

    Genomyske basis fan de giga-chromosomen en giga-genoom fan beampioen Paeonia ostii

    2015

    NP

    7.43

    Domestication footprints anker genomyske regio's fan agronomysk belang yn sojabonen

    2018

    MP

    9.32

    Folsleine-genoom-resequencing fan in wrâldwide kolleksje fan raapsied-oankomsten ûntbleatet de genetyske basis fan har ekotype-diverginsje

    2022

    HR

    7.29

    Genome-wide assosjaasjeanalyse jout molekulêre ynsjoch yn 'e natuerlike fariaasje fan watermeloen siedgrutte

    krije in offerte

    Skriuw jo berjocht hjir en stjoer it nei ús

    Stjoer jo berjocht nei ús: