● Heech belibbe: Mear dan 200.000-samples binne ferwurke yn BMK dy't ferskate sampletypen befetsje, ynklusyf selkultuer, weefsel, lichemfloeistof, ensfh.
● Strikt kwaliteitskontrôlesysteem: Kearnkwaliteitskontrôlepunten troch alle stappen ynklusyf sample tarieding, biblioteek tarieding, sequencing en bioinformatics binne ûnder nau tafersjoch om te leverjen hege-kwaliteit resultaten.
● Meardere databases beskikber foar funksje annotaasje en ferriking stúdzjes te ferfoljen ferskate ûndersyk doelen.
● Tsjinsten nei ferkeap: Tsjinsten nei ferkeap jildich foar 3 moannen nei projektfoltôging, ynklusyf projektopfolging, troubleshooting, resultaten Q&A, ensfh.
Biblioteek | Sequencing strategy | Gegevens oanrikkemandearre | Kwaliteitsbeweitsing |
Poly A ferrike | Illumina PE150 | 6 gb | Q30≥85% |
Nukleotiden:
Konk.(ng/μl) | Bedrach (μg) | Purity | Yntegriteit |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Beheinde as gjin proteïne- of DNA-fersmoarging werjûn op gel. | Foar planten: RIN≥6.5; Foar bisten: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; beheind of gjin baseline hichte |
Tissue: Gewicht (droech):≥1 g
* Foar weefsel lytser dan 5 mg, riede wy oan om flash beferzen (yn floeibere stikstof) weefselmonster te stjoeren.
Cell suspension:Seltal = 3×106- 1×107
* Wy riede oan om beferzen sel lysate te ferstjoeren.Yn gefal dat sel telt lytser as 5 × 105.
Bloedmonsters:Volume ≥1 ml
Mikroorganisme:Massa ≥ 1 g
Container: 2 ml centrifuge tube (Tin folie is net oan te rieden)
Sample labeling: Groep + replikearje bgl. A1, A2, A3;B1, B2, B3......
Ferstjoering:
Bioinformatika
Eukaryotyk mRNA sequencing analyze workflow
Bioinformatika
ØRaw gegevens kwaliteit kontrôle
ØReferinsje genome alignment
ØTranskripsjestruktuer analyze
ØEkspresje kwantifikaasje
ØDifferinsjaal ekspresje analyze
ØFunksje annotaasje en ferriking
1.mRNA Data Saturation kromme
2.Differinsjaal ekspresje analyze-Fulcano plot
3.KEGG annotaasje op DEGs
4.GO klassifikaasje op DEGs