Illumina en BGI
Features
●Platfoarms:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten en BGI-DNB-T7
●Sequence modes:PE50, PE100, PE150, PE250
●Kwaliteitskontrôle fan biblioteken foardat sequencing
●Sequence fan gegevenslevering en QC:levering fan QC rapport en rauwe gegevens yn fastq opmaak nei demultiplexing en filterjen Q30 reads.
Service Foardielen
●Veelzijdigheid fan sequencing tsjinsten:de klant kin kieze om te foltôgjen troch baan, streamsel of hoemannichte gegevens.
●Veelzijdigheid fan platfoarms:DNB-biblioteken kinne wurde oerdroegen oan Illumina-platfoarms
●Wiidweidige ûnderfining op Illumina sequencing platfoarm:mei tûzenen sletten projekten mei ferskate soarten.
●Levering fan folchoarder QC rapport:mei kwaliteitsmetriken, gegevenskrektens en algemiene prestaasjes fan it sequencing-projekt.
●Mature sequencing proses:mei koarte omlooptiid.
●Rigorous Quality Control: wy implementearje strange QC-easken om de levering fan konsekwint heechweardige resultaten te garandearjen.
Sample Requirements *
Partial Lane Sequencing
| Gegevensbedrach (X) | Konsintraasje (qPCR/nM) | Folume |
| X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| 50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
| X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Single Lane (Illumina)
| Perron | Konsintraasje (qPCR/nM) | Folume |
| HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
| NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
| BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
Neist konsintraasje en totale bedrach is ek in gaadlik pykpatroan nedich.
Nim asjebleaft kontakt mei ús op as jo samples net foldogge oan de easken foar útgongsmateriaal.
Service Workflow
Bibleteek kwaliteit kontrôle
Sequencing
Gegevens kwaliteit kontrôle
Projekt levering
Bibleteek QC rapport
In rapport oer de kwaliteit fan 'e bibleteek wurdt levere foardat sequencing, beoardieling fan biblioteekbedrach en fragmintaasje.
Sequencing QC rapport
Tabel 1. Statistiken op sekwinsje gegevens.
| Sample ID | BMKID | Raw lêst | Raw Data (bp) | Skjin lêzen (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
figuer 1. Kwaliteit ferdieling lâns lêzen yn eltse stekproef
figuer 2. Basis ynhâld distribúsje
figuer 3. Ferdieling fan lêzen ynhâld yn sequencing gegevens
