BMKMANU S1000 Romtlike transkriptoom
BMKMANU S1000 Romtlike Transkriptom Technysk Scheme
Foardielen fan BMKMANU S1000
1) Sub-sellulêre resolúsje: Elk fangengebiet befette> 2 miljoen romtlike barcoded spots mei in diameter fan 2.5 µm en in ôfstân fan 5 µm tusken spotsintra, wêrtroch romtlike transkriptoomanalyse mei sub-sellulêre resolúsje (5 µm) mooglik is.
2) Multi-level resolúsje analyze: Fleksibele multi-level analyze fariearjend fan 100 μm oant 5 μm te lossen ferskate weefsel funksjes op optimale resolúsje.
3) Wiidweidige transkriptoomprofilearring: Transkrippen dy't fan 'e heule weefselslide fêstlein binne kinne wurde analysearre, sûnder beheining op oantal doelgenen en doelgebiet.
Service Spesifikaasjes
| Biblioteek | Sequencing strategy | Data Output oanrikkemandearre |
| S1000 cDNA bibleteek | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60Gb/sample |
Sample Requirments
| Foarbyld | Nûmer | Grutte | RNA kwaliteit |
| OCT ynbêde weefselblok | 2-3 blokken / sample | Ca.6.8x6.8x6.8 mm3 | RIN≥7 |
Foar mear details oer sample tarieding begelieding en tsjinst workflow, nim dan gerêst te praten mei inBMKGENE ekspert
Service Work Flow
Eksperimint ûntwerp
Sample levering
Pre-eksperimint
Romtlike barcoding
Biblioteekbou
Sequencing
Data analyze
Nei-ferkeap tsjinsten
De gegevens generearre troch BMKMANU S1000 wurde analysearre mei de software "BSTMatrix", dy't ûnôfhinklik is ûntwurpen troch BMKGENE, ynklusyf:
1) Gene ekspresje matrix generaasje
2) HE byldferwurking
3) Kompatibel mei downstream software fan tredden foar analyse
4) Online "BSTViewer" helpt om fisualisaasjeresultaten te krijen by ferskate resolúsjes.
1.Spot klustering
2. Romtlike ferdieling
Note: Resolúsjenivo=13 (100 µm, links); 7 (50 µm, rjochts)
3.Marker útdrukking oerfloed clustering heatmap
4.Inter-sample data analyze
