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Séquençage d’ARN mononucléaire
Les avancées dans la technique de capture de cellules uniques et de construction de bibliothèques individuelles, combinées au séquençage à haut débit, permettent des études d’expression génique cellule par cellule.Il permet une analyse système plus approfondie et complète sur des populations cellulaires complexes, dans laquelle il évite largement de masquer leur hétérogénéité en prenant la moyenne de toutes les cellules.
Cependant, certaines cellules ne conviennent pas pour être transformées en suspension unicellulaire, c'est pourquoi d'autres méthodes de préparation d'échantillons (extraction du noyau à partir de tissus) sont nécessaires, c'est-à-dire que le noyau est directement extrait des tissus ou des cellules et préparé en suspension à noyau unique pour un usage unique. séquençage cellulaire.
BMK propose un service de séquençage d’ARN unicellulaire basé sur 10 × Genomics ChromiumTM.Ce service a été largement utilisé dans des études liées à des maladies, telles que la différenciation des cellules immunitaires, l'hétérogénéité des tumeurs, le développement des tissus, etc.
Puce de transcriptome spatial : 10× Génomique
Plateforme : Plateforme Illumina NovaSeq
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Transcriptome spatial BMKMANU S1000
La transcriptomique spatiale est à la pointe de l’innovation scientifique, permettant aux chercheurs d’approfondir les modèles complexes d’expression génétique au sein des tissus tout en préservant leur contexte spatial.Parmi diverses plates-formes, BMKGene a développé la puce de transcriptome spatial BMKManu S1000, dotée d'unerésolution amélioréede 5 µM, atteignant la plage subcellulaire et permettantparamètres de résolution à plusieurs niveaux.La puce S1000, comportant environ 2 millions de points, utilise des micropuits recouverts de billes chargées de sondes de capture à codes-barres spatiales.Une bibliothèque d'ADNc, enrichie de codes-barres spatiaux, est préparée à partir de la puce S1000 puis séquencée sur la plateforme Illumina NovaSeq.La combinaison d’échantillons codés spatialement et d’UMI garantit l’exactitude et la spécificité des données générées.L'attribut unique de la puce BMKManu S1000 réside dans sa polyvalence, offrant des paramètres de résolution à plusieurs niveaux qui peuvent être finement ajustés à différents tissus et niveaux de détail.Cette adaptabilité positionne la puce comme un choix exceptionnel pour diverses études de transcriptomique spatiale, garantissant un regroupement spatial précis avec un bruit minimal.
Grâce à la puce BMKManu S1000 et à d'autres technologies de transcriptomique spatiale, les chercheurs peuvent mieux comprendre l'organisation spatiale des cellules et les interactions moléculaires complexes qui se produisent au sein des tissus, fournissant ainsi des informations inestimables sur les mécanismes sous-jacents aux processus biologiques dans un large éventail de domaines, notamment oncologie, neurosciences, biologie du développement, immunologie et études botaniques.
Plateforme : puce BMKManu S1000 et Illumina NovaSeq
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10x Transcriptome spatial de Visium génomique
La transcriptomique spatiale est une technologie de pointe qui permet aux chercheurs d’étudier les modèles d’expression génétique au sein des tissus tout en préservant leur contexte spatial.Une plateforme puissante dans ce domaine est 10x Genomics Visium couplé au séquençage Illumina.Le principe du 10X Visium repose sur une puce spécialisée avec une zone de capture désignée où sont placées les coupes de tissus.Cette zone de capture contient des points à code-barres, chacun correspondant à un emplacement spatial unique dans le tissu.Les molécules d'ARN capturées dans les tissus sont ensuite étiquetées avec des identifiants moléculaires uniques (UMI) au cours du processus de transcription inverse.Ces spots à codes-barres et UMI permettent une cartographie spatiale précise et une quantification de l’expression des gènes à une résolution unicellulaire.La combinaison d’échantillons codés spatialement et d’UMI garantit l’exactitude et la spécificité des données générées.En utilisant cette technologie de transcriptomique spatiale, les chercheurs peuvent acquérir une compréhension plus approfondie de l'organisation spatiale des cellules et des interactions moléculaires complexes se produisant au sein des tissus, offrant ainsi des informations inestimables sur les mécanismes sous-jacents aux processus biologiques dans de multiples domaines, notamment l'oncologie, les neurosciences, la biologie du développement et l'immunologie. , et études botaniques.
Plateforme : 10X Genomics Visium et Illumina NovaSeq
