Alors que le séquençage de l'ARNm basé sur NGS constitue un outil polyvalent pour la quantification de l'expression génique, son recours à des lectures courtes limite son efficacité dans les analyses transcriptomiques complexes.Le séquençage PacBio (Iso-Seq), quant à lui, utilise une technologie à lecture longue, permettant le séquençage de transcrits d'ARNm complets.Cette approche facilite une exploration complète de l'épissage alternatif, des fusions de gènes et de la poly-adénylation, bien qu'elle ne constitue pas le choix principal pour la quantification de l'expression des gènes.La combinaison 2+3 comble le fossé entre Illumina et PacBio en s'appuyant sur les lectures PacBio HiFi pour identifier l'ensemble complet des isoformes de transcription et le séquençage NGS pour la quantification des mêmes isoformes.
Plateformes : PacBio Sequel II et Illumina NovaSeq