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PacBio-Transcriptome complet (non-référence)

En prenant comme entrée les données de séquençage des isoformes de Pacific Biosciences (PacBio), cette application est capable d'identifier des séquences de transcription complètes (sans assemblage).En cartographiant des séquences complètes par rapport au génome de référence, les transcrits peuvent être optimisés par des gènes, des transcrits, des régions codantes connus, etc. Dans ce cas, une identification plus précise des structures d'ARNm, telles qu'un épissage alternatif, etc., peut être obtenue.L'analyse conjointe avec les données de séquençage du transcriptome NGS permet une annotation plus complète et une quantification plus précise de l'expression au niveau de la transcription, ce qui profite largement à l'expression différentielle et à l'analyse fonctionnelle en aval.


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