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Derniers cas réussis sur le séquençage d'ARN Nanopore avec les technologies de biomarqueurs
Séquençage complet du transcriptome basé sur les nanopores Le séquençage des nanopores se distingue des autres plates-formes de séquençage, en ce sens que les nucléotides sont lus directement sans synthèse d'ADN et génèrent de longues lectures à des dizaines de kilobases.Cela permet une redirection directe...
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Application du séquençage complet des amplicons aux études sur la diversité microbienne
ÉCOLOGIE MICROBIENNE L'intensification agricole réduit la complexité du réseau microbien et l'abondance des taxons clés dans les racines Séquençage d'amplicons complet (IT...
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Étude de la communauté et de la fonction du microbiome dans le sol traité par des bactéries immobilisées par séquençage 16S complet
MICROBIEN La compatibilité bactérienne et l'immobilisation avec le biochar ont amélioré la dégradation du tébuconazole, la composition et le fonctionnement du microbiome du sol Séquençage complet de l'amplicon 16S |PacBio HiFi |Diversité alpha |Bêta di...
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Performance des lectures longues de nanopores dans les études métagénomiques
MÉTAGÉNOMIQUE Génomes bactériens complets et fermés issus de microbiomes grâce au séquençage des nanopores Séquençage des nanopores |Métagénomique |MAG |Circularisation du génome bactérien |Le microbiote intestinal...
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Application du reséquençage à lecture longue Nanopore dans la lutte contre les maladies
GÉNOMIQUE HUMAINE nature génétique Le séquençage à lecture longue identifie les expansions répétées de GGC dans NOTCH2NLC associées à la maladie d'inclusion intranucléaire neuronale Reséquençage ONT |Illumine |Séquençage de l'exome entier |Séquence ciblée CRISPR-Cas9 ONT...
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Application du re-séquençage basé sur les nanopores dans l’identification des variantes génétiques du COVID19
RESÉQUENAGE DU GÉNOME ENTIER La surveillance génomique du SRAS-CoV-2 révèle une variante de délétion Nsp1 qui module la réponse à l'interféron de type I Nanopore |Illumine |Reséquençage du génome entier |métagénomique |ARN-Seq |Sanger Bioma...
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Variantes de structure dans la population chinoise et leur impact sur les phénotypes, les maladies et l'adaptation de la population
RESÉQUENÇAGE DU GÉNOME ENTIER Variantes de structure dans la population chinoise et leur impact sur les phénotypes, les maladies et l'adaptation de la population Nanopore |PacBio |Re-séquençage du génome entier |Appel de variation structurelle Dans ce s...
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Quatre génomes animaux et végétaux assemblés télomère à télomère
T2T GENOME ASSEMBLY, GAP FREE GENOME 1st Two Rice Genomes1 Titre : L'assemblage et la validation de deux génomes de référence sans Gap pour le riz Xian/indica révèlent un aperçu de l'architecture des centromères végétaux Doi : https://doi.org/10.1101/2020.12.24.424073 Post ...
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Les séquences du génome révèlent des voies de dispersion mondiales et suggèrent des adaptations génétiques convergentes dans l'évolution des hippocampes
ÉVOLUTION DU GÉNOME nature COMMUNICATIONS Les séquences du génome révèlent des voies de dispersion globales et suggèrent des adaptations génétiques convergentes dans l'évolution des hippocampes PacBio |Illumine |Salut-C |WGS |Diversité génétique |Histoire démographique |Flux de gènes...
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Un assemblage génomique de haute qualité met en évidence les caractéristiques génomiques du seigle et les gènes agronomiquement importants
ÉVOLUTION DU GÉNOME génétique naturelle Un assemblage génomique de haute qualité met en évidence les caractéristiques génomiques du seigle et les gènes agronomiquement importants PacBio |Illumine |Carte optique Bionano |Assemblée du génome Hi-C |Carte génétique |Balayages sélectifs |ARN....
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Assemblage à l'échelle chromosomique et analyse du génome de la culture de biomasse Miscanthus lutarioriparius
GÉNOME Assemblage et analyse à l'échelle chromosomique du génome de la biomasse de Miscanthus lutarioriparius Séquençage des nanopores |Illumine |Salut-C |Séquençage d'ARN |Phylogénie Dans cette étude, Biomarker Techno...
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Le génome de Nautilus pompilius éclaire l'évolution des yeux et la biominéralisation
ÉVOLUTION DU GÉNOME Le génome de Nautilus pompilius éclaire l'évolution de l'œil et la biominéralisation Séquençage PacBio |Illumine |Analyse phylogénétique |Séquençage d'ARN |MEB |Protéomique...
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