L'exploration des modèles d'expression génique à l'emplacement d'origine d'un organisme est cruciale pour comprendre les types et les fonctions de ses cellules.Cependant, les méthodes actuelles d’analyse du transcriptome spatial présentent des limites telles qu’un faible débit ou une résolution insuffisante.La puce spatiale BMKMANU S1000, développée par BMKMANU, peut détecter des informations sur l'expression génique in situ dans des coupes de tissus complètes à une résolution subcellulaire, permettant une interprétation nuancée de la structure tissulaire.
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Composants du produit
La puce spatiale BMKMANU S1000 et le kit de réactifs correspondants comprennent :
1) Kit d'optimisation des tissus, contenant des réactifs pour l'optimisation des tissus (exploration du temps optimal pour la perméabilisation des tissus).
2) Kit d'expression génétique, contenant des réactifs pour capturer l'ARNm dans des tranches de tissus pour la préparation et le séquençage ultérieurs de la bibliothèque.
3) Kit de démarrage : comprend un adaptateur thermostatique et un séparateur magnétique du transcriptome.
Principe technique
La puce est basée sur des micropores et des microbilles, et l'ARNm peut être capturé in situ via Oligo sur les microbilles.L'Oligo est composé de quatre parties : Read1, Spatial Barcode, UMI et Poly(dT)VN.Une fois le tissu attaché à la puce, l’ARNm est libéré du tissu par une enzyme de perméabilisation.Étant donné que la plupart des extrémités 3' de l'ARNm ont une queue Poly-A, elles sont capturées par Oligo avec Poly(dT)VN.Après amplification RT-PCR et ADNc, préparation de la bibliothèque et séquençage, le traçage de la position spatiale est réalisé via Spatial Barcode.Cela permet l’analyse de l’expression génique dans les emplacements spatiaux et l’hétérogénéité des tissus.
Avantages du produit
Applications
Il peut être appliqué à la plupart des domaines de la recherche biologique et médicale, notamment les tumeurs, les maladies, l’immunologie et la biologie du développement, contribuant ainsi à réaliser de nouvelles avancées dans ces domaines grâce à l’analyse de l’expression spatiale à une résolution subcellulaire.
● Tumeur et maladie :
Hétérogénéité spatiale et microenvironnement des tumeurs et maladies
Apparition et développement de tumeurs et de maladies
Réponse au traitement des tumeurs et des maladies
●Biologie du développement
Atlas spatiotemporel des organes
Mécanismes de régulation des gènes au cours du développement
●Réponse au stress
Réponse au stress biotique
Réponse au stress abiotique
●Immunologie
Réponse immunitaire lors d'une transplantation d'organe
Mécanismes immunitaires des tumeurs et des maladies
Pathogenèse des maladies auto-immunes
●Analyse de la résistance aux médicaments
Mécanismes de résistance aux médicaments
Recherche et développement de nouveaux médicaments
Cas et données de démonstration
Les performances du BMKMANU S1000 ont été vérifiées dans des centaines de cas sur différents types de tissus.
