Les isoformes alternatives complexes et variables dans les organismes sont des mécanismes génétiques importants pour réguler l'expression des gènes et la diversité des protéines.L'identification précise des structures de transcription constitue la base d'une étude approfondie des modèles de régulation de l'expression génique.La plateforme de séquençage des nanopores a réussi à amener l’étude transcriptomique au niveau des isoformes.Cette plateforme d'analyse est conçue pour analyser les données RNA-Seq générées sur la plateforme Nanopore sur la base du génome de référence, ce qui permet de réaliser des analyses qualitatives et quantitatives à la fois au niveau des gènes et au niveau des transcriptions.