Génome fongique
Avantages des services
● Plusieurs stratégies de séquençage disponibles pour différents objectifs de recherche
● Très expérimenté dans l'assemblage du génome des champignons avec plus de 10 000 génomes péné-complets assemblés.
● Équipe de support technique après-vente professionnelle répondant à des besoins de recherche plus spécifiques.
Spécifications des services
| Service | Stratégie de séquençage | Qualité garantie | Délai d'exécution estimé |
| Carte fine fongique | Illumina 50X+Nanopore 100X | Contig N50≥2 Mo | 35 jours ouvrables |
| PacBio HiFi 30X | |||
| Carte complète du pénis fongique | Illumina 50X + Nanopore 100X (Pacbio HiFi 30X) + Hi-C 100X | Taux d'ancrage chromosomique >90 % | 45 jours ouvrables |
Analyses bioinformatiques
● Contrôle qualité des données brutes
● Assemblage du génome
● Analyse des composants du génome
● Annotation de la fonction du gène
● Analyse génomique comparative
Exigences et livraison des échantillons
Exigences de l'échantillon :
PourExtraits d'ADN:
| Échantillon type | Montant | Concentration | Pureté |
| Extraits d'ADN | ＞ 1,2 μg | > 20 ng/μl | DO260/280 = 1,6-2,5 |
Pour les échantillons de tissus :
| Échantillon type | Traitement des échantillons recommandé | Stockage et expédition des échantillons |
| Champignon unicellulaire | Observer les levures au microscope et les récolter dans leur phase exponentielle Transférer la culture (contenant environ 3 à 4,5e9 cellules) dans un eppendorf de 1,5 ou 2 ml.(Gardez sur la glace) Centrifuger le tube 1 min à 14 000 g pour récolter les bactéries et retirer délicatement le surnageant Scellez le tube et congelez les bactéries dans l’azote liquide pendant au moins 1 à 3 h.Conservez le tube au réfrigérateur à -80 ℃. | Congelez les échantillons dans de l'azote liquide pendant 3 à 4 heures et conservez-les dans de l'azote liquide ou à -80 degrés pour une réservation à long terme.L’envoi d’un échantillon avec de la glace carbonique est requis. |
| Champignon macro | Des tissus en phase de croissance active sont recommandés. Rincer le tissu avec de l'eau sans endotoxine, puis avec de l'éthonal à 70 %. Enregistrez l'échantillon dans des cryotubes. |
Flux de travail des services
Livraison d'échantillon
Construction d'une bibliothèque
Séquençage
L'analyse des données
Services après-vente
1.Diagramme Circos sur les composants génomiques fongiques
2.Analyse génomique comparative : Arbre phylogénétique
