Analyse de l'ARNm eucaryote (avec référence)
Sur la base de la séquence génomique connue et des informations d'annotation, une nouvelle génération de données de séquençage à haut débit (RNA-Seq) est utilisée comme entrée, et les nouveaux sites de transcription (nouveau gène) et les nouveaux événements d'épissage variable sont identifiés.évaluation de la qualité des données de séquençage ;données de séquençage et alignement des séquences du génome de référence sélectionné, identification des limites exon/intron, analyse de l'épissage des variants du gène, exploration des régions du gène et des nouveaux transcrits, identification des sites SNP de la région transcrite, de la limite entre les 3' et 5 ' gènes, ainsi que l'annotation fonctionnelle et l'analyse d'enrichissement de différents échantillons (groupes).
ARN longs non codants
Les ARN longs non codants (lncRNA) sont un type de transcrits d’une longueur supérieure à 200 nt, qui sont incapables de coder les protéines.Les preuves accumulées suggèrent que la plupart des ARNnc sont très probablement fonctionnels.Les technologies de séquençage à haut débit et les outils d’analyse bioinformatique nous permettent de révéler plus efficacement les séquences d’ARNlnc et les informations de positionnement et nous amènent à découvrir des ARNlnc dotés de fonctions de régulation cruciales.BMKCloud est fier de fournir à ses clients une plateforme d'analyse de séquençage d'ARNlnc pour réaliser une analyse d'ARNlnc rapide, fiable et flexible.
Séquençage d'amplicons 16S/18S/ITS
La plateforme d'analyse de la diversité microbienne est développée avec des années d'expérience dans l'analyse de projets de diversité microbienne, qui contient une analyse de base standardisée et une analyse personnalisée : l'analyse de base couvre le contenu d'analyse principal de la recherche microbienne actuelle, le contenu de l'analyse est riche et complet et les résultats de l'analyse sont présentés. sous forme de rapports de projets ;Le contenu de l’analyse personnalisée est diversifié.Les échantillons peuvent être sélectionnés et les paramètres peuvent être définis de manière flexible en fonction du rapport d'analyse de base et de l'objectif de recherche, pour répondre à des exigences personnalisées.Système d'exploitation Windows, simple et rapide.
Métagénomique des fusils de chasse (NGS)
Les données métagénomiques sont utilisées pour analyser les matériaux génomiques mixtes extraits d'échantillons environnementaux, qui fournissent des informations détaillées sur la diversité et l'abondance des espèces, la structure de la population, les relations phylogénétiques, les gènes fonctionnels et le réseau de corrélation avec les facteurs environnementaux.
NGS-WGS (Illumina/BGI)
Un pipeline d'analyse intégré développé pour les professionnels de la recherche sans connaissances préalables en bioinformatique et fonctionnant sur un serveur hautes performances.Il facilite l'exécution rapide de tâches telles que le contrôle de la qualité des données, l'alignement des séquences, la détection des variations SNP/InDel/SV, l'annotation et le gène de mutation.
GWAS
À l’aide de méthodologies statistiques spécifiques, l’analyse GWAS vise à découvrir les variations nucléotidiques à l’échelle du génome corrélées aux différences phénotypiques.Il joue un rôle crucial dans l’exploration des gènes fonctionnels associés à des maladies humaines complexes et à des traits complexes chez les plantes et les animaux.
BSA
La plateforme d'analyse intégrée fournit une interface conviviale pour une analyse de la diversité standardisée et personnalisée.L'analyse BSA implique de regrouper des individus présentant des traits phénotypiques extrêmes provenant d'une population en ségrégation.En comparant les loci différentiels entre les échantillons regroupés, cette approche identifie rapidement des marqueurs moléculaires étroitement liés associés aux gènes cibles.Largement utilisé dans la cartographie génétique des plantes et des animaux, il constitue un outil précieux pour la sélection assistée par marqueurs et le positionnement des gènes.
Génétique évolutive
Il s'agit d'un flux de travail d'analyse intégré conçu pour les professionnels de la recherche ayant une expertise bioinformatique limitée.Tirant parti de la vaste expérience de BMKGENE dans les projets d'évolution génétique, cette plateforme fonctionne sur des serveurs hautes performances, garantissant une exécution rapide et précise d'analyses personnalisées.Celles-ci englobent des tâches telles que la construction d'arbres phylogénétiques, l'analyse du déséquilibre de liaison, l'évaluation de la diversité génétique, l'identification par balayage sélectif, l'analyse de parenté, l'analyse en composantes principales et la caractérisation de la structure de la population.
