BMKGENE a fourni des services complets de séquençage du transcriptome utilisant les technologies PacBio et ONT pour une étude intitulée « Analyse comparative des méthodes de séquençage de l'ARN PacBio et ONT pour l'identification du venin de Nemopilema Nomurai », publiée dans la revue Genomics.L'étude visait à comparer l'efficacité des méthodes de séquençage d'ARN PacBio et ONT pour identifier le venin de l'espèce de méduse Nemopilema nomurai.
Les résultats de l’étude suggèrent que l’ONT produisait généralement des données brutes de meilleure qualité dans l’analyse du transcriptome, tandis que PacBio générait des longueurs de lecture plus longues.PacBio s'est avéré supérieur dans l'identification des séquences codantes et de l'ARN non codant à longue chaîne, tandis que l'ONT était plus rentable pour prédire les événements d'épissage alternatifs, les répétitions de séquences simples et les facteurs de transcription.
Cette étude a des implications significatives pour les futures technologies de séquençage chez les méduses marines et met en évidence la puissance de l’analyse complète du transcriptome pour découvrir des cibles thérapeutiques potentielles pour la dermatite des méduses.
Cliquez suricipour en savoir plus sur cet article.
Heure de publication : 20 décembre 2023