Le 20 mai est la Journée mondiale de l'abeille !Les abeilles sont des pollinisateurs essentiels qui contribuent à la diversité et à la productivité des écosystèmes, ainsi qu'à la production de cultures vivrières qui nourrissent les humains et les animaux.
L’abeille asiatique est une espèce pollinisatrice importante qui joue un rôle vital dans l’agriculture et les services écosystémiques.Le projet de génome d'A. cerana a été publié à l'aide de la technologie NGS en 2015, qui était très fragmentée et manquait d'échafaudage au niveau des chromosomes, ce qui rendait nécessaire l'obtention de séquences génomiques plus complètes et plus précises.
L'un des cas de réussite de BMKGENE, une équipe de chercheurs de Chine et d'Australie a publié une nouvelle étude intitulée « Un assemblage à l'échelle chromosomique du génome de l'abeille asiatique Apis cerana ».Dans cette étude, ils présentent un assemblage à l’échelle chromosomique hautement contigu du génome d’A. cerana en utilisant une combinaison de séquençage à lecture longue PacBio et de données Hi-C.L'assemblage mis à jour a une taille de 215,67 Mo avec un contig N50 de 4,49 Mo, ce qui représente une amélioration de 212 fois par rapport à la version précédente basée sur Illumina.Le nouvel assemblage présentait également un niveau d'exhaustivité plus élevé, avec 97,6 % des BUSCO présents, contre seulement 86,9 % lors de l'assemblage précédent.Les chercheurs ont mené des analyses génomiques plus précises et plus complètes, telles que la prédiction de nouveaux gènes et la détection de variations structurelles, ce qui pourrait avoir des implications importantes pour la compréhension de la biologie et de l'évolution de cette espèce.
BMKEGENE possède une vaste expérience dans l’assemblage du génome de haute qualité et se réjouit de vous fournir nos services.
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Heure de publication : 22 mai 2023