● Épuisement de l'ARNr suivi d'une préparation directionnelle de bibliothèques, permettant le séquençage de données spécifiques à un brin.
● Le flux de travail bioinformatique permet la prédiction et la quantification de l'expression des circARN
●Bibliothèques d'ARN plus complètes :nous utilisons l'épuisement de l'ARNr au lieu de l'épuisement linéaire de l'ARN dans notre préparation en pré-bibliothèque, garantissant que les données de séquençage incluent non seulement l'ARNcirc mais également l'ARNm et l'ARNnc, permettant une analyse conjointe de ces ensembles de données
●Analyse facultative des réseaux compétitifs d’ARN endogènes (ceRNA): fournir des informations plus approfondies sur les mécanismes de régulation cellulaire
●Une expertise étendue: avec une expérience dans le traitement de plus de 20 000 échantillons chez BMK, couvrant divers types d'échantillons et des projets lncRNA, notre équipe apporte une richesse d'expérience à chaque projet.
●Contrôle qualité rigoureux: nous mettons en œuvre des points de contrôle de base à toutes les étapes, de la préparation des échantillons et des bibliothèques au séquençage et à la bioinformatique.Ce suivi méticuleux garantit la fourniture de résultats constants de haute qualité.
● Assistance après-vente: Notre engagement s'étend au-delà de la réalisation du projet avec une période de service après-vente de 3 mois.Pendant cette période, nous proposons un suivi de projet, une assistance au dépannage et des séances de questions-réponses pour répondre à toute question liée aux résultats.
Bibliothèque | Plate-forme | Données recommandées | CQ des données |
Poly A enrichi | Illumina PE150 | 16-20 Go | Q30≥85 % |
Conc. (ng/μl) | Quantité (μg) | Pureté | Intégrité |
≥ 100 | ≥ 0,5 | DO260/280=1,7-2,5 DO260/230=0,5-2,5 Contamination limitée ou inexistante en protéines ou en ADN indiquée sur le gel. | Pour les plantes : RIN≥6,5 ; Pour les animaux : RIN≥7,0 ; 5,0≥28S/18S≥1,0 ; élévation de la ligne de base limitée ou inexistante |
● Plantes :
Racine, tige ou pétale : 450 mg
Feuille ou graine : 300 mg
Fruits : 1,2 g
●Animal :
Coeur ou Intestin : 450 mg
Viscères ou Cerveau : 240 mg
Muscles : 600 mg
Os, cheveux ou peau : 1,5 g
● Arthropodes :
Insectes : 9g
Crustacés : 450 mg
● Sang total :2 tubes
● Cellules : 106 cellules
● Sérum et Plasma: 6 ml
Récipient : tube à centrifuger de 2 ml (le papier d'aluminium n'est pas recommandé)
Étiquetage des échantillons : Groupe + répétition, par exemple A1, A2, A3 ;B1, B2, B3... ...
Expédition:
1. Glace sèche : Les échantillons doivent être emballés dans des sacs et enterrés dans de la neige carbonique.
2. Tubes RNAstable : les échantillons d'ARN peuvent être séchés dans un tube de stabilisation d'ARN (par exemple RNAstable®) et expédiés à température ambiante.
Bioinformatique
Prédiction des circARN : distribution chromosomique
CirARN exprimés différentiellement – Graphique du volcan
CirARN exprimés différentiellement – regroupement hiérarchique
Enrichissement fonctionnel des gènes hôtes du circRNA
Explorez les progrès de la recherche facilités par les services de séquençage des circARN de BMKGene grâce à une collection organisée de publications.
Wang, X. et coll.(2021) « CPSF4 régule la formation de circARN et l'inactivation génique médiée par les microARN dans le carcinome hépatocellulaire », Oncogene 2021 40:25, 40(25), pp. 4338-4351.est ce que je: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et coll.(2023) « Le transcriptome sensible à X oo révèle le rôle de l'ARN circulaire 133 dans la résistance aux maladies en régulant l'expression d'OsARAB dans le riz », Phytopathology Research, 5(1), pp.est ce que je: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
Y, H. et coll.(2023) « CPSF3 module l'équilibre des transcriptions circulaires et linéaires dans le carcinome hépatocellulaire ».est ce que je: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. et al.(2023) « Évaluation complète des circARN dans la cardiomyopathie cirrhotique avant et après une transplantation hépatique », International Immunopharmacology, 114, p.109495. est ce que je : 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.