Des produits

Transcriptome spatial BMKMANU S1000

L'organisation spatiale des cellules joue un rôle essentiel dans divers processus biologiques, tels que l'infiltration immunitaire, le développement de l'embryon, etc. Le séquençage spatial du transcriptome, qui indique le profilage de l'expression génique tout en conservant les informations sur la position spatiale, a fourni d'excellentes informations sur l'architecture tissulaire au niveau du transcriptome.Avec le développement de la technologie, la morphologie tissulaire ultra-claire et la différence structurelle réelle de l’expression moléculaire spatiale doivent être étudiées avec une résolution plus élevée.BMKGENE fournit un service complet et unique de séquençage spatial du transcriptome, des échantillons aux informations biologiques.

Les technologies de transcriptomique spatiale ont donné naissance à de nouvelles perspectives dans divers domaines de recherche en résolvant le profil d'expression génique avec un contenu spatial dans des échantillons hétérogènes.

Puce de transcriptome spatial : BMKMANU S1000

Plateforme : Plateforme Illumina NovaSeq

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Détails des services

Bioinformatique

Résultats de la démonstration

Schéma technique du transcriptome spatial BMKMANU S1000

Avantages du BMKMANU S1000

1) Résolution sous-cellulaire : chaque zone de capture contenait plus de 2 millions de points spatiaux à code-barres d'un diamètre de 2,5 µm et d'un espacement de 5 µm entre les centres des points, permettant une analyse spatiale du transcriptome avec une résolution sous-cellulaire (5 µm).

2) Analyse à résolution multi-niveaux : analyse multi-niveaux flexible allant de 100 μm à 5 μm pour résoudre diverses caractéristiques des tissus à une résolution optimale.

3) Profilage complet du transcriptome : les transcriptions capturées à partir de la lame de tissu entière peuvent être analysées, sans restriction sur le nombre de gènes cibles et la zone cible.

Spécifications des services

Bibliothèque	Stratégie de séquençage	Sortie de données recommandée
Bibliothèque d'ADNc S1000	BMKMANU S1000-Illumina PE150	60 Go/échantillon

Exigences des échantillons

Échantillon	Nombre	Taille	Qualité de l'ARN
Bloc de tissu intégré OCT	2-3 blocs/échantillon	Environ.6,8x6,8x6,8mm³	RIN≥7

Pour plus de détails sur les conseils de préparation des échantillons et le flux de travail du service, n'hésitez pas à parler à unExpert BMKGENE

Flux de travail des services

Conception d'expériences

Livraison d'échantillon

Pré-expérience

Code-barres spatial

Construction d'une bibliothèque

Séquençage

L'analyse des données

Services après-vente

Précédent: 10x Transcriptome spatial de Visium génomique

Suivant: Séquençage du génome entier de plantes/animaux

Les données générées par BMKMANU S1000 sont analysées à l'aide du logiciel « BSTMatrix », conçu indépendamment par BMKGENE, comprenant :

1) Génération de matrice d’expression génique
2) Traitement d'images HE
3) Compatible avec les logiciels tiers en aval pour l'analyse
4) « BSTViewer » en ligne permet d'obtenir des résultats de visualisation à différentes résolutions.

1. Regroupement ponctuel

s1000 (4)