-
BSA
Bulked Segregant Analysis -alusta koostuu yksivaiheisesta standardianalyysistä ja edistyneestä analyysistä mukautetuilla parametriasetuksilla.BSA on tekniikka, jota käytetään fenotyyppiin liittyvien geneettisten markkerien nopeaan tunnistamiseen.BSA:n päätyönkulku sisältää: 1. kahden yksilöryhmän valitsemisen, joilla on äärimmäisen vastakkaiset fenotyypit;2. yhdistämällä kaikkien yksilöiden DNA, RNA tai SLAF-seq (kehittäjä Biomarker) kahden DNA-osan muodostamiseksi;3. identifioidaan differentiaaliset sekvenssit vertailugenomia vastaan tai niiden väliltä, 4. ennustetaan ehdokasliitettyjä alueita ED- ja SNP-indeksialgoritmilla;5. Toiminnallinen analyysi ja geenien rikastaminen ehdokasalueilla jne. Saatavilla on myös edistyneempää tiedon louhintaa, mukaan lukien geneettisten markkerien seulonta ja alukkeiden suunnittelu.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) -alusta on kehitetty vuosien kokemuksella mikrobien monimuotoisuuden projektianalyysistä, joka sisältää standardoidun perusanalyysin ja personoidun analyysin: perusanalyysi kattaa nykyisen mikrobitutkimuksen valtavirran analyysisisällön, analyysisisältö on rikas ja kattava, ja analyysitulokset esitetään projektiraporttien muodossa;Henkilökohtaisen analyysin sisältö on monipuolinen.Näytteitä voidaan valita ja parametreja asettaa joustavasti perusanalyysiraportin ja tutkimustarkoituksen mukaan yksilöllisten vaatimusten toteuttamiseksi.Windows-käyttöjärjestelmä, yksinkertainen ja nopea.
-
Evoluutiogenetiikka
Evoluutiogenetiikka on pakattu sekvensointipalvelu, joka on suunniteltu tarjoamaan kattavan tulkinnan tiettyjen materiaalien evoluutiotiedoista geneettisten muunnelmien perusteella, mukaan lukien SNP:t, InDels, SV ja CNV.Se tarjoaa kaiken perustavanlaatuisen analyysin, jota tarvitaan populaatioiden evoluutiomuutosten ja geneettisten ominaisuuksien, kuten populaatiorakenteen, geneettisen monimuotoisuuden, filogeneettisten suhteiden jne. kuvaamiseen. Se sisältää myös geenivirtaa koskevia tutkimuksia, jotka mahdollistavat tehokkaan populaation koon ja poikkeamisajan arvioinnin.
-
Vertaileva genomiikka
Vertaileva genomiikka tarkoittaa kirjaimellisesti eri lajien täydellisten genomisekvenssien ja rakenteiden vertaamista.Tämän tieteenalan tavoitteena on paljastaa lajien evoluutio, geenitoiminta, geenien säätelymekanismi genomitasolla tunnistamalla sekvenssirakenteet ja elementit, jotka säilyivät tai erottuivat eri lajeissa.Tyypillinen vertaileva genomiikkatutkimus sisältää analyysit geeniperheestä, evoluutiokehityksestä, koko genomin monistamisesta, selektiivisestä paineesta jne.
-
Evoluutiogenetiikka
Populaatio- ja evoluutiogeenianalyysialusta on perustettu BMK:n tutkimus- ja kehitystiimin vuosien ajan kertyneen valtavan kokemuksen pohjalta.Se on käyttäjäystävällinen työkalu erityisesti tutkijoille, jotka eivät ole pääaineenaan bioinformatiikkaa.Tämä alusta mahdollistaa evoluutiogenetiikkaan liittyvän perusanalyysin, mukaan lukien fylogeneettisen puun rakentamisen, kytkentäepätasapainoanalyysin, geneettisen monimuotoisuuden arvioinnin, valikoivan pyyhkäisyanalyysin, sukulaisuusanalyysin, PCA:n, populaatiorakenneanalyysin jne.
-
Hi-C-pohjainen genomikokoonpano
Hi-C on menetelmä, joka on suunniteltu kaappaamaan kromosomikonfiguraatio yhdistämällä läheisyyteen perustuvia vuorovaikutuksia ja korkean suorituskyvyn sekvensointia.Näiden vuorovaikutusten intensiteetin uskotaan korreloivan negatiivisesti kromosomien fyysisen etäisyyden kanssa.Siksi Hi-C-data voisi ohjata koottujen sekvenssien ryhmittymistä, järjestämistä ja suuntaamista luonnosgenomissa ja ankkuroimalla ne tiettyyn määrään kromosomeja.Tämä tekniikka mahdollistaa kromosomitason genomikokoonpanon populaatiopohjaisen geneettisen kartan puuttuessa.Jokainen genomi tarvitsee Hi-C:n.
Alusta: Illumina NovaSeq Platform / DNBSEQ
-
Kasvien/eläinten de Novo genomin sekvensointi
De Novosekvensointi viittaa lajin koko genomin rakentamiseen käyttämällä sekvensointiteknologioita, esim. PacBio, Nanopore, NGS jne. referenssigenomin puuttuessa.Kolmannen sukupolven sekvensointitekniikoiden lukupituuden huomattava parannus on tuonut uusia mahdollisuuksia koota monimutkaisia genomeja, kuten sellaisia, joissa on korkea heterotsygoottisuus, korkea toistuvien alueiden suhde, polyploideja jne. Lukupituuden ollessa kymmenien kiloemästen tasolla nämä sekvensointilukemat mahdollistavat toistuvien elementtien, epänormaalin GC-sisällön alueiden ja muiden erittäin monimutkaisten alueiden ratkaiseminen.
Alusta: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq Platform
-
Ihmisen koko eksomin sekvensointi
Koko eksomien sekvensointia (WES) pidetään kustannustehokkaana sekvensointistrategiana sairauksia aiheuttavien mutaatioiden tunnistamisessa.Vaikka eksonit vievät vain noin 1,7 % koko genomista, se edustaa suoraan proteiinien kokonaistoimintojen profiilia.Ihmisen genomissa on raportoitu, että yli 85 % sairauteen liittyvistä mutaatioista tapahtuu proteiinia koodaavalla alueella.
BMKGENE tarjoaa kattavia ja joustavia ihmisen koko eksomin sekvensointipalveluita erilaisilla eksonien sieppausstrategioilla eri tutkimustavoitteiden saavuttamiseksi.
Alusta: Illumina NovaSeq Platform
-
Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)
Korkean suorituskyvyn genotyypitys, erityisesti laajamittaisessa populaatiossa, on perustavanlaatuinen vaihe geneettisissä assosiaatiotutkimuksissa, mikä tarjoaa geneettisen perustan funktionaalisten geenien löytämiselle, evoluutioanalyysille jne. Syvän koko genomin uudelleensekvensoinnin sijasta genomin sekvensoinnin vähentäminen (RRGS) ).Tämä saavutetaan tavallisesti uuttamalla restriktiofragmentti tietyllä kokoalueella, jota kutsutaan nimellä RRL (Reduced representation library).Spesifisen lokuksen monistettu fragmenttisekvenssi (SLAF-Seq) on itse kehitetty strategia SNP-genotyypitykseen referenssigenomin kanssa tai ilman sitä.
Alusta: Illumina NovaSeq Platform -
Illumina ja BGI
Illumina-sekvensointitekniikka, joka perustuu Sequencing by Synthesis (SBS) -tekniikkaan, on maailmanlaajuisesti hyväksytty NGS-innovaatio, joka tuottaa yli 90 % maailman sekvensointitiedoista.SBS:n periaatteessa kuvataan fluoresoivasti leimattuja palautuvia terminaattoreita, kun kutakin dNTP:tä lisätään, ja sen jälkeen pilkkotaan seuraavan emäksen sisällyttämisen mahdollistamiseksi.Kun kaikki neljä palautuvaa terminaattoriin sitoutunutta dNTP:tä ovat läsnä kussakin sekvensointisyklissä, luonnollinen kilpailu minimoi inkorporaatiovirheen.Tämä monipuolinen tekniikka tukee sekä yksilukuisia että parillisia kirjastoja, jotka palvelevat erilaisia genomisovelluksia.Illumina-sekvensoinnin korkean suorituskyvyn ja tarkkuuden ansiosta se on genomiikan tutkimuksen kulmakive, mikä antaa tutkijoille mahdollisuuden selvittää genomien monimutkaisuutta vertaansa vailla yksityiskohtaisesti ja tehokkaasti.
BGI:n kehittämä DNBSEQ on toinen innovatiivinen NGS-tekniikka, joka on onnistunut vähentämään sekvensointikustannuksia entisestään ja lisäämään suorituskykyä.DNBSEQ-kirjastojen valmistaminen sisältää DNA-fragmentoinnin, ssDNA:n valmistuksen ja pyörivän ympyrän monistamisen DNA-nanopallojen (DNB) saamiseksi.Nämä ladataan sitten kiinteälle pinnalle ja sekvensoidaan sen jälkeen kombinatorisella koetin-ankkurisynteesillä (cPAS).
Valmiiksi tehty kirjaston sekvensointipalvelumme auttaa asiakkaita valmistamaan sekvensointikirjastojaan eri lähteistä (mm. mRNA, koko genomi, amplikoni).Myöhemmin nämä kirjastot voidaan toimittaa sekvensointikeskuksillemme laadunvalvontaa ja sekvensointia varten Illumina- tai BGI-alustoilla.
