Erilaisten sekvensointitekniikoiden suorituskyky metagenomiikan ratkaisemisessa.
Tällä luennolla hän esittelee eri sekvensointitekniikoiden sovelluksia mikrobiomin ymmärtämisessä, mukaan lukien niiden tekniset työnkulut, esitykset ja eräät tapaustutkimukset.Puheenvuorossa käsitellään seuraavia asioita:
● Yleistä nykyisiin mikrobiomiprofilointimenetelmiin
● Amplicon-pohjainen metabarcoding-sekvensointi: Näytteen valmistelusta datan tulkintaan
● Mitä muuta voimme odottaa metaviivakoodaukselta: PacBio-pohjainen täyspitkä amplikonin sekvensointi
● Haulikkometagenomin sekvensointi antaa kattavamman kuvan toiminnallisista geeneistä
● Nanohuokospohjainen metagenomisekvensointi