BMKCloud Log in
条形banneri-03

Uutiset

ruis

Kohokohdat

Tähän kaksituntiseen webinaariin on suuri kunnia saada kutsua kuusi viljelykasvien genomiikka-areenan asiantuntijaa.Puhujamme antavat syvällisen tulkinnan kahdesta Ruis-genomitutkimuksesta, jotka julkaistiin juuri äskettäinLuonnon genetiikka:

1. Kromosomimittakaavainen genomikokoonpano tarjoaa näkemyksiä rukiin biologiasta, evoluutiosta ja agronomisista mahdollisuuksista
2. Laadukas genomikokoonpano korostaa rukiin genomiominaisuuksia ja agronomisesti tärkeitä geenejä

Olemme myös iloisia saadessamme Biomarker Technologiesin vanhemman T&K-tutkijan jakamaan kokemuksensa de novo genomin kokoamisesta.

Agenda

09:00 CET

Tervetulleita huomautuksia

1-1-1

Zheng Hong-kun

Biomarker Technologiesin perustaja ja toimitusjohtaja

2-1-1

Deng Xing-wang

Pekingin yliopiston Advanced Agricultural Sciences Schoolin presidentti

Tehostaa rukiin, ruisvehnän ja vehnän parannusta käyttämällä korkealaatuista referenssigenomisekvenssiä

3-1-2
Prof. Nils Stein, Henanin maatalousyliopisto

Tässä webinaarissa professori Wang antoi meille yleiskatsauksen triticeae-genomitutkimuksen nykytilasta ja osoitti rukiin genomitutkimuksen kahden erinomaisen työn menestystä ja läpimurtoja, jotka juuri julkaistiin Nature Geneticsissä ja esittelevät koko tutkimuksen. töitä johtavat ja niihin osallistuvat ryhmät.

Viljan genomiikka @ IPK Gatersleben

4-1-1
Professori Wang Dao-wen, Leibnizin kasvigenetiikan ja viljelykasvien tutkimuksen instituutti (IPK)

Triticeae-heimon viljaheinät ovat olleet tärkeä ravinnonlähde lauhkealla vyöhykkeellä, jota on pitkään pidetty sadon parantamisen ja jalostuksen hotspot-alueena.Kaikista viljellyistä lajeista tämä heimo on kuuluisa äärimmäisen monimutkaisista genomiominaisuuksistaan, kuten suuresta genomikoosta, korkeasta TE:iden pitoisuudesta, polyploidiasta jne. Tässä istunnossa prof. Nils Stein esitteli meille yleisesittelyn IPK Gaterslebenistä ja viljan nykytilasta. genomitutkimus@IPK Gatersleben.

Kromosomimittakaavainen genomikokoonpano tarjoaa oivalluksia rukiin biologiaan, evoluutioon ja agronomiseen potentiaaliin

5-1-1
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Leibnizin kasvigenetiikan ja viljelysuunnitelmatutkimuksen instituutti (IPK)

Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Leibnizin kasvigenetiikan ja viljelysuunnitelmatutkimuksen instituutti (IPK)Ruis (Secale cereale L.) on poikkeuksellisen ilmastonkestävä viljakasvi, jota käytetään laajasti parannettujen vehnälajikkeiden tuottamiseen introgressiivisen hybridisaation avulla ja jolla on koko hybridijalostuksen mahdollistamiseen tarvittava geenivalikoima.Ruis on allogamia ja vasta äskettäin kesytetty, mikä antaa viljellylle rukiille pääsyn monipuoliseen ja hyödynnettävissä olevaan luonnonvaraiseen geenipooliin.Parantaaksemme entisestään rukiin agronomista potentiaalia, tuotimme kromosomimittakaavaisen annotoidun 7,9 Mbp rukiin genomin kokoonpanon ja validoimme laajasti sen laadun käyttämällä molekyyligeneettisiä resursseja.Esittelemme tämän resurssin sovelluksia laajalla valikoimalla tutkimuksia.Esittelemme havaintoja viljellyn rukiin epätäydellisestä geneettisestä eristäytymisestä luonnonvaraisista sukulaisista, genomin rakenteellisen evoluution mekanismeista, patogeenien vastustuskyvystä, matalan lämpötilan sietokyvystä, hybridijalostuksen hedelmällisyyden säätöjärjestelmistä sekä rukiin ja vehnän introgressioiden tuottoeduista.

Laadukas genomikokonaisuus korostaa rukiin genomiominaisuuksia ja agronomisesti tärkeitä geenejä

6-1-1
Tri Li Guang-wei, Henanin maatalousyliopisto

Ruis on arvokas ravinto- ja rehukasvi, tärkeä geneettinen resurssi vehnän ja ruisvehnän parantamisessa sekä korvaamaton materiaali heinäkasvien tehokkaissa vertailevissa genomiikkatutkimuksissa.Täällä sekvensoimme Weining-rukiin genomin, kiinalaisen ruislajikkeen eliitin.Kokoonpanot (7,74 Gb) edustivat 98,47 % arvioidusta genomin koosta (7,86 Gb), ja 93,67 % jatkuvista (7,25 Gb) oli osoitettu seitsemään kromosomiin.Toistuvat elementit muodostivat 90,31 % kootusta genomista.Verrattuna aiemmin sekvensoituihin Triticeae-genomeihin Daniela, Sumaya ja Sumana retrotransposonit osoittivat voimakasta laajentumista rukiissa.Weining-kokoonpanon lisäanalyysit tuovat uutta valoa genomin laajuisiin geenien päällekkäisyyksiin ja niiden vaikutukseen tärkkelyksen biosynteesigeeneihin, monimutkaisten prolamiinilokusten fysikaalisiin organisaatioihin, varhaisen suuntausominaisuuden taustalla oleviin geeniekspressioominaisuuksiin ja oletettuihin kesytykseen liittyviin kromosomialueisiin ja -lokuksiin rukiissa.Tämä genomisekvenssi lupaa nopeuttaa rukiin ja siihen liittyvien viljakasvien genomiikkaa ja jalostustutkimuksia.

Genomin de novo -kokoonpanon haasteita, ratkaisuja ja tulevaisuutta

7-1
Li Xu-ming, vanhempi T&K-tutkija, Biomarker Technologies

Laadukas genomi on genomitutkimuksen perusta.Vaikka sekvensoinnin ja algoritmien nopea kehitys on mahdollistanut paljon yksinkertaisemman ja tehokkaamman genomin kokoamisen, myös kokoonpanon tarkkuuden ja täydellisyyden vaatimukset nousevat tutkimustavoitteiden syvenemisen myötä.Tässä puheessa käsittelen tämänhetkisiä suosittuja tekniikoita genomin kokoamisessa useiden onnistuneiden tapausten kanssa ja katson tulevaa kehitystä.


Postitusaika: 08.01.2022

Lähetä viestisi meille: