BMKCloud Log in
条形banneri-03

Uutiset

MIKROBI

Journal of-Hazardous- Materials

Bakteerien yhteensopivuus ja immobilisointi biohiilen kanssa paransi tebukonatsolin hajoamista, maaperän mikrobiomien koostumusta ja toimintaa

Täyspitkä 16S-amplikonin sekvensointi |PacBio HiFi |Alfa monimuotoisuus |Beta-monimuotoisuus

Tässä tutkimuksessa Biomarker Technologies tarjosi täyspitkän 16S-amplikonin sekvensoinnin PacBion avulla ja bioinformaattisen analyysin.

Kohokohdat

Biohiilellä immobilisoidun tebukonatsolia hajottavan bakteerin Alcaligenes faecalis WZ-2 tutkittiin biologisen hajoamisen tehokkuuden ja vaikutuksen suhteen tebukonatsolipitoiseen maaperään verrattuna vapaasti hajoavaan kantaan WZ-2.

1. Biohiilellä immobilisoitu WZ-2 osoitti tehokkaamman hajoamisen tebukonatsolissa verrattuna vapaaseen WZ-2:een vähentämällä tebukonatsolin puoliintumisaikaa maaperässä 18,7 päivästä 13,3 päivään.

2. Biohiilellä immobilisoidut WZ-2:t pystyivät palauttamaan maaperän mikrobien entsyymiaktiivisuudet, mukaan lukien ureaasin, dehydrogenaasin ja invertaasin jne.

3. Mikrobiprofiili biohiilellä immobilisoidussa WZ-2-käsitellyssä maaperässä, joka määritettiin täyspitkällä 16S-sekvensoinnilla, tuki vahvasti sitä, että tämä järjestelmä voisi palauttaa maaperän terveyden parantamalla bakteeriyhteisön rakennetta tebukonatsolikontaminaation alaisena.

Kokeilu (sekvensointiin liittyvä)

Ryhmittely: CK: Luonnollinen maaperä;T: Tebukonatsolilla lisätty maaperä;S: Tebukonatsoli sisälsi maaperää, jossa oli vapaa kanta WZ-2;BC: Tebukonatsoli sisälsi maaperää, jossa oli biohiiltä;BCS: Tebukonatsoli sisälsi maaperää, jossa oli biohiilellä immobilisoitua WZ-2:ta.

Näytteenotto: 16S rDNA-alukkeilla monistettu maaperän DNA:n kokonaisuutto
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) ja 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),edustaa täyspitkää 16S rDNA:ta

Sekvensointialusta: PacBio RS II

Sekvensointistrategia: CCS HIFI lukee

Tietojen analysointi:BMKCloudBioinformatic Platforming tekee kultakalasta erinomaisen geneettisen mallijärjestelmän kalojen fysiologiaan ja evoluutioon.

Tulos

Maaperän mikrobiyhteisön rakenne määritettiin 16S rDNA -sekvensoinnilla.OTU:n rikkaus- ja alfadiversiteettiindeksi, mukaan lukien Chao1-, Ace-, Shannon- ja Simpson-indeksit, arvioitiin paljastamaan lajien monimuotoisuus kussakin järjestelmässä.60 päivän inkuboinnin jälkeen kaikki indeksit osoittivat samansuuntaista suuntausta, eli tebukonatsoli saattoi vähentää lajien rikkautta ja monimuotoisuutta maaperässä.Kuitenkin lisäämällä kantaa WZ-2 maaperän bakteeriyhteisö saatiin osittain talteen sekä rikkauden että monimuotoisuuden suhteen.Rajoitettu ero havaittiin BC:n, BCS:n ja CK:n välillä, mikä osoittaa, että biohiilellä ja biohiilellä immobilisoitu WZ-2 voisi tehokkaasti palauttaa maaperän biologisen terveyden.

1-2-1024x218

Tässä tutkimuksessa sovellettiin painottamatonta pariryhmämenetelmää aritmeettisilla keskiarvoilla (UPGMA) beetan monimuotoisuuden osoittamiseksi ryhmien välillä.Kuten seuraavassa kuvassa näkyy, BC:llä, BSC:llä ja CK:lla oli samanlainen mikrobikoostumuskuvio verrattuna ryhmään T ja S, mikä osoitti edelleen, että biohiilen lisääminen tebukonatsolilla saastuneeseen maaperän bioremediaatioon voisi suurelta osin helpottaa mikrobiyhteisön palautumista maaperään.

2-1-1024x472

Kuva.Bakteeriyhteisön UPGMA-klusterointi syrjätasolla erilaisilla hoidoilla

Viite

Sun, Tong et ai."Bakteereiden yhteensopivuus ja immobilisaatio biohiilen kanssa paransivat tebukonatsolin hajoamista, maaperän mikrobiomien koostumusta ja toimintaa."Journal of Hazardous Materials398 (2020): 122941.

Lue koko teksti

Uutisia ja kohokohtia Tavoitteena on jakaa uusimmat onnistuneet tapaukset Biomarker Technologiesin kanssa, vangita uusia tieteellisiä saavutuksia sekä tutkimuksen aikana käytettyjä merkittäviä tekniikoita.


Postitusaika: 08.01.2022

Lähetä viestisi meille: