BMKCloud Log in
条形banneri-03

Uutiset

PERIMÄ

Nature_Communications_Logo

Biomassasadon Miscanthus lutarioriparius -genomin kromosomimittakaavainen kokoonpano ja analyysi

Nanopore-sekvensointi |Illumina |Hi-C |RNA-sekvensointi |Fylogeny

Tässä tutkimuksessa Biomarker Technologies tarjosi teknistä tukea Nanopore-sekvensoinnille, de novo -genomin kokoonpanolle, Hi-C-avusteiselle kokoonpanolle jne.

Abstrakti

Miscanthus, juurakoinen monivuotinen kasvi, jolla on suuret mahdollisuudet bioenergian tuotantoon sen korkean biomassan ja stressinsietokyvyn vuoksi.Raportoimme kromosomimittakaavaisen kokoonpanonMiscanthus lutarioripariusgenomia yhdistämällä Oxford Nanopore -sekvensointi ja Hi-C-teknologiat.2,07 Gb:n kokoonpano kattaa 96,64 % genomista, ja N50:n jatkuvuus on 1,71 Mb.Sentromeeri- ja telomeerisekvenssit kootaan kaikille 19 kromosomille ja kromosomille 10, vastaavasti.M. lutarioripariuksen allotetraploidinen alkuperä varmistetaan käyttämällä sentromeerisiä satelliittitoistoja.Tetraploidinen genomirakenne ja useat kromosomaaliset uudelleenjärjestelyt suhteessa durraan ovat selvästi osoitettu.Tandem-kaksoisgeenitM. lutarioripariusovat toiminnallisesti rikastuneet paitsi stressivasteeseen, myös soluseinän biosynteesiin liittyvien termien suhteen.Taudin vastustuskykyyn, soluseinän biosynteesiin ja metalli-ionien kuljetukseen liittyvät geeniperheet ovat laajentuneet ja kehittyneet suuresti.Näiden perheiden laajentaminen voi olla tärkeä genomiperusta, jolla parannetaan merkittäviä ominaisuuksiaM. lutarioriparius.

Genomin kokoonpanon keskeiset tilastot

uutiset-1
uutiset-2

Kuva.M. lutarioripariuksen genomikokoonpanon yleiskatsaus

Uutisia ja kohokohtia Tavoitteena on jakaa uusimmat onnistuneet tapaukset Biomarker Technologiesin kanssa, vangita uusia tieteellisiä saavutuksia sekä tutkimuksen aikana käytettyjä merkittäviä tekniikoita.


Postitusaika: 05.01.2022

Lähetä viestisi meille: