Monimutkaiset ja vaihtelevat vaihtoehtoiset isomuodot organismeissa ovat tärkeitä geneettisiä mekanismeja geenien ilmentymisen ja proteiinien monimuotoisuuden säätelyssä.Transkriptirakenteiden tarkka tunnistaminen on perusta geeniekspression säätelymallien syvälliselle tutkimukselle.Nanopore-sekvensointialusta on onnistuneesti tuonut transkriptiotutkimuksen isoformitasolle.Tämä analyysialusta on suunniteltu analysoimaan Nanopore-alustalla tuotettua RNA-Seq-dataa referenssigenomin perusteella, mikä mahdollistaa kvalitatiiviset ja kvantitatiiviset analyysit sekä geenitasolla että transkriptitasolla.