Genominlaajuinen assosiaatiotutkimus (GWAS) pyrkii tunnistamaan geneettisiä variantteja (genotyyppi), jotka liittyvät tiettyihin piirteisiin (fenotyyppi).GWA-tutkimukset tutkivat geneettisiä markkereita ylittävät suuren määrän yksilöitä koko genomin ja ennustavat genotyyppi-fenotyyppi-assosiaatioita tilastollisen analyysin avulla populaatiotasolla.Koko genomin uudelleensekvensointi voi mahdollisesti löytää kaikki geneettiset variantit.Yhdistettynä fenotyyppitietoihin GWAS voidaan käsitellä fenotyyppiin liittyvien SNP:iden, QTL:iden ja ehdokasgeenien tunnistamiseksi, mikä tukee vahvasti nykyaikaista eläin-/kasvinjalostusta.SLAF on itse kehitetty yksinkertaistettu genomin sekvensointistrategia, joka löytää genominlaajuiset hajautetut markkerit, SNP.Näitä SNP:itä molekyyligeneettisinä markkereina voidaan käsitellä assosiaatiotutkimuksia varten kohdistetuilla piirteillä.Se on kustannustehokas strategia monimutkaisten piirteisiin liittyvien geneettisten muunnelmien tunnistamisessa.
