BMKGENE tarjosi spatiaalisia transkriptoimisekvensointipalveluita tutkimukseen "STEEL mahdollistaa spatiotemporaalisen transkriptomisen datan korkearesoluutioisen rajaamisen", joka julkaistiin Briefings in Bioinformatics -julkaisussa.
Tässä tutkimuksessa ehdotettiin valvomatonta ja monimuotoista oppimiseen perustuvaa algoritmia, Spatial Transcriptome cEll typE -klusterointia (STEEL), joka tunnistaa alueita spatiaalisesta transkriptomista klusteroimalla helmiä, joilla on sekä hyvin samankaltaiset geeniekspressioprofiilit että läheinen avaruudellinen etäisyys graafien tapaan.
Kattava STEEL-arviointi 10X Visium -alustan spatiaalisista transkriptomisista tiedoista osoittaa, että sillä ei vain saavuteta korkeaa resoluutiota hiiren aivojen hienojen rakenteiden karakterisoimiseksi, vaan se mahdollistaa myös useiden yksittäin analysoitujen kudoslevyjen integroinnin suuremmaksi.
Avaruustranskriptomiteknologioiden kehittymisen myötä menetelmällämme on suuri käyttökelpoisuus domeenien tunnistamisessa ja geeniekspression atlasrekonstruktiossa.
Klikkaustässäsaadaksesi lisätietoja tästä tutkimuksesta.
Postitusaika: 20.10.2023