Yksi tärkeä puutarhataloudellinen ominaisuus, joka erottaa napaappelsiinit muista tavallisista makeista appelsiinilajikkeista, on navan läsnäolo hedelmässä.Tämä ominaisuus on myös tärkeä kriteeri makeiden appelsiinin puutarhaviljelylajikkeiden luokittelussa.
BMKGENEN asiakkaat käyttivät BMKGENEN itse kehittämää SLAF-sekvensointiteknologiaa suorittaakseen tutkimuksen nimeltä "Hedelmien laatuun liittyvien geenien louhinta makeissa appelsiineissa spesifisen lokuksen monistetun fragmentin sekvensoinnin perusteella."
Tutkimuksessa sekvensoitiin 240 makean appelsiinin ituplasmaresurssia, joilla on laaja geneettinen monimuotoisuus ja erilainen maantieteellinen alkuperä, mikä johti 497,82 Mt lyhytlukutietoa.Tietojen analyysi tuotti 1 467 968 SNP-genotyyppiä koko genomissa.Fst-analyysiä käyttämällä tutkimuksessa tunnistettiin kuusi ehdokasgeeniä, jotka liittyvät navan esiintymiseen, hedelmän painoon ja titrattavaan happamuuteen, mikä tarjosi perustan makean appelsiinilajikkeiden kohdistetulle parantamiselle.
Laajamittaisessa populaatiosekvensoinnissa spesifinen locus amplified fragment -sekvensointi (SLAF) on kustannustehokkaampaa ja tehokkaampaa verrattuna koko genomin sekvensointiin (WGS).
Klikkaustässäsaadaksesi lisätietoja tästä tutkimuksesta.
Postitusaika: 5.12.2023