Genomin kokoonpanon, populaation evoluution, genetiikan ja molekyylibiologian yhteinen analyysi on suositeltava tapa kertoa tutkimuskohteen täydellinen biologinen tarina.Viime kuussa professori Jiawei Wang ja hänen tiiminsä julkaisivat Nature Communications -tutkimuksensa nimeltä "Yleinen evolutionaarinen kehityskulku lyhyen elinkaaren aikana Brassicaceae ruderal rikkakasveissa", joka saattaa innostaa sinua.
Tässä tutkimuksessa Cardamine occultan genomi koottiin de novo ja merkittiin annotaatioon, samoin kuin 87 alkuperästä kerättyä C. occulta -näytettä sekvensoitiin uudelleen.Evoluutioanalyysissä havaittiin, että yksi evoluutiohaara oli levinneimmin levinnyt, joka kykeni sopeutumaan toistuviin ihmisen toiminnan häiriöihin ja leviämään ihmisen toiminnan mukana.Tämä haara erottui merkittävästi geneettisesti sukulaishaaroista kukinnan säätelyreitillä, koska se ei kyennyt reagoimaan vernalisaatioreittiin tai valojakson reittiin.Geneettisten populaatioiden BSA-analyysin ja siirtogeenisten kasvien toiminnallisen todentamisen avulla FLC ja CRY2 tunnistettiin ja vahvistettiin C. occultan geneettisiksi perustaksi reagoimaan vernalisaatio- ja valojaksoreitteihin.
Lisätietoja tästä paperista osoitteessahttps://www.nature.com/articles/s41467-023-35966-7
BMKGENE on kerännyt kokemusta de novo genomin kokoonpano- ja koko genomin uudelleensekvensointipalveluiden tarjoamisesta tätä tutkimusta varten.Odotamme innollatoimittaaingluotetut sekvensointipalvelut, jotka auttavat tutkijoita saavuttamaan tavoitteensa.
Postitusaika: 08-08-2023