● Erittäin kokenut: BMK:ssa on käsitelty yli 200 000 näytettä, jotka kattavat erilaisia näytetyyppejä, kuten soluviljelmiä, kudoksia, kehon nesteitä jne., ja yli 7 000 mRNA-Seq-projektia on suljettu eri tutkimusalueilta.
● Tiukka laadunvalvontajärjestelmä: Laadunvalvontapisteitä kaikissa vaiheissa, mukaan lukien näytteen valmistelu, kirjaston valmistelu, sekvensointi ja bioinformatiikka, seurataan tarkasti korkealaatuisten tulosten saamiseksi.
● Käytettävissä on useita tietokantoja toimintomerkintöjä ja rikastustutkimuksia varten erilaisten tutkimustavoitteiden saavuttamiseksi.
● Myynnin jälkeiset palvelut: Myynnin jälkeiset palvelut ovat voimassa 3 kuukautta projektin päätyttyä, mukaan lukien projektin seuranta, vianetsintä, tulosten kysymykset ja vastaukset jne.
Kirjasto | Sekvensointistrategia | Tietoja suositellaan | Laadunvalvonta |
Poly A rikastettu | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85 % |
Nukleotidit:
Konsentraatio (ng/μl) | Määrä (μg) | Puhtaus | Rehellisyys |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Geelissä näkyy rajoitettu proteiini- tai DNA-kontaminaatio tai ei ollenkaan. | Kasveille: RIN≥6,5; Eläimet: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; rajallinen tai ei ollenkaan perustason nousua |
Kudos: Paino (kuiva):≥1 g
*Alle 5 mg:n kudokselle suosittelemme pakastetun (nestemäisessä typessä) kudosnäytteen lähettämistä.
Solususpensio:Solumäärä = 3×106- 1×107
* Suosittelemme pakastetun solulysaatin lähettämistä.Jos solujen määrä on pienempi kuin 5 × 105.
Verinäytteitä:Tilavuus≥1 ml
Mikro-organismi:Paino ≥ 1 g
Säiliö: 2 ml sentrifugiputki (tinafoliota ei suositella)
Näytemerkintä: Ryhmä+kopio esim. A1, A2, A3;B1, B2, B3.....
Lähetys:
Bioinformatiikka
Eukaryootti mRNA-sekvensointianalyysin työnkulku
Bioinformatiikka
ØRaakatietojen laadunvalvonta
ØViitegenomin kohdistus
ØTranskription rakenneanalyysi
ØIlmaisujen kvantifiointi
ØDifferentiaalinen ilmentymisanalyysi
ØFunktiomerkintä ja rikastus
1.mRNA Data Saturaatiokäyrä
2.Differentiaalinen ilmentymisanalyysi - Tulivuorikaavio
3.KEGG-merkintä DEG:issä
4.GO-luokitus DEG:issä