Tuotteet

DNA/RNA-sekvensointi – Nanopore-sekvensointilaite

DNA/RNA-sekvensointi – Nanopore-sekvensaattorilla esitelty kuva

ONT-sekvensointi on yhden molekyylin reaaliaikainen sähkösignaalin sekvensointitekniikka, joka perustuu nanohuokosiin, jokaisen alustan sekvensointiperiaate on sama.Kaksijuosteinen DNA/RNA sitoutuu biofilmiin upotettuun nanohuokoiseen proteiiniin, joka purkautuu moottoriproteiinin johdolla, biofilmin molemmilta puolilta tulevan jännite-eron vaikutuksesta DNA/RNA-säikeet kulkevat nanohuokoskanavaproteiinin läpi tietyssä pisteessä. korko.DNA/RNA-juosteen eri emästen kemiallisten ominaisuuksien eroista johtuen, kun yksittäinen emäs tai DNA-molekyyli kulkee nanohuokoskanavan läpi, se aiheuttaa erilaisten sähköisten signaalien muutoksen.Näitä signaaleja havaitsemalla ja vastaamalla voidaan laskea vastaavat kantatyypit ja suorittaa sekvenssin reaaliaikainen ilmaisu.

Ota meihin yhteyttä

Palvelun tiedot

Demo tulos

Palvelun tiedot Ominaisuudet

Alusta	Kirjaston koko	Teoreettinen datan tuotto (solua kohti)	Yhden pohjan tarkkuus	Sovellukset
Nanopore	8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR	70-90Gb/solu	85-92 %	SV-kutsu, De novo, Täyspitkä sekvensointi, Iso-Seq, Geenimerkintä, DNA-metylaation havaitseminen

Palvelun edut

● Yli 5 vuoden kokemus PacBio-sekvensointialustasta, jossa on tuhansia suljettuja projekteja eri lajeilla.
● BMKGENE on Oxford Nanoporen virallinen kumppani, jolla on kaksialustainen RNA/DNA-sertifiointi.
● On olemassa yleisiä sekvenssereitä, joissa on täydellinen varustus ja riittävä sekvensointikapasiteetti.
● Nanopore-alustaan perustuen yli 10 Denovon eläin- ja kasvitutkimusta on julkaistu kansainvälisesti tunnetuissa aikakauslehdissä.

Esimerkkivaatimukset

Näytteen tyyppi

Määrä

Keskittyminen (Qubit ®)

Äänenvoimakkuus

Puhtaus

muut

Genominen DNA

Riippuu tietovaatimuksista

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280 = 1,7-2,2;

OD260/230≥1,5；

Kirkas piikki 260 nm:ssä, ei kontaminaatioita

Pitoisuus on mitattava arvoilla Qubit ja Qubit/Nanopore ≤ 2

Kokonais-RNA

≥1,2 μg

≥100 μg/μl

≥15μl

OD260/280 = 1,7-2,5;

OD260/230=0,5-2,5；ei kontaminaatioita

RIN-arvo ≥7,5

Palvelun työnkulku

näytteen valmistus

Kirjaston rakentaminen

Jaksotus

Tietojen analysointi

Projektin toimitus

Edellinen: DNA/RNA-sekvensointi – Illumina-sekvensointilaite

Seuraava: Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)

DNA-näytteen tietojen laadun arviointi

Taulukko 1. Puhtaiden tietojen tilastot.

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	puhdasN50Len	puhdasN90Len	cleanMeanLen	cleanMaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	1,218,239	26.37	1,121,736	25.90	28,014	15,764	23,090	143,181	9