BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome Technical Scheme
BMKMANU S1000:n edut
1) Solun alainen resoluutio: Kukin sieppausalue sisälsi > 2 miljoonaa spatiaalista viivakoodattua täplää, joiden halkaisija oli 2,5 µm ja pistekeskuksien välinen etäisyys 5 µm, mikä mahdollisti spatiaalisen transkription analyysin solun alaresoluutiolla (5 µm).
2) Monitasoinen resoluutioanalyysi: Joustava monitasoinen analyysi 100 μm:stä 5 μm:iin erilaisten kudosten ominaisuuksien ratkaisemiseksi optimaalisella resoluutiolla.
3) Kattava transkriptiprofilointi: Koko kudoslevyltä kaapatut transkriptit voidaan analysoida ilman rajoituksia kohdegeenien lukumäärään ja kohdealueeseen.
Palvelun tiedot
| Kirjasto | Sekvensointistrategia | Datan ulostuloa suositellaan |
| S1000 cDNA-kirjasto | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60Gb/näyte |
Esimerkkivaatimukset
| Näyte | Määrä | Koko | RNA laatu |
| OCT-sulautettu kudoskatkos | 2-3 lohkoa/näyte | Noin6,8x6,8x6,8 mm3 | RIN≥7 |
Saat lisätietoja näytteiden valmistelun ohjeista ja palvelun työnkulusta ottamalla yhteyttä aBMKGENE asiantuntija
Palvelun työnkulku
Kokeilusuunnittelu
Näytteen toimitus
Esikokeilu
Spatiaalinen viivakoodi
Kirjaston rakentaminen
Jaksotus
Tietojen analysointi
Myynnin jälkeiset palvelut
BMKMANU S1000:n tuottamat tiedot analysoidaan BMKGENEN itsenäisesti suunnittelemalla BSTMatrix-ohjelmistolla, mukaan lukien:
1) Geeniekspressiomatriisin generointi
2) HE-kuvankäsittely
3) Yhteensopiva loppupään kolmannen osapuolen ohjelmistojen kanssa analysointia varten
4) Online "BSTViewer" auttaa saamaan visualisointituloksia eri resoluutioilla.
1.Spot-klusterointi
2. Alueellinen jakautuminen
Nhuom: Resoluutiotaso = 13 (100 µm, vasemmalle); 7 (50 µm, oikein)
3. Markkerin ilmaisun runsausklusteroinnin lämpökartta
4. Näytteiden välinen tietojen analyysi
