توالی رونوشت کامل - ایلومینا
امکانات
● کتابخانه دوگانه برای توالی رونوشت کامل: تخلیه rRNA به دنبال آماده سازی کتابخانه PE150 و انتخاب اندازه به دنبال آماده سازی کتابخانه SE50
● تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک کامل mRNA، lncRNA، circRNA و miRNA در گزارش‌های بیوانفورماتیک جداگانه
● تجزیه و تحلیل مشترک بیان تمام RNA در گزارش ترکیبی، از جمله تجزیه و تحلیل شبکه های ceRNA.
مزایای خدمات
●تحلیل عمیق شبکه های نظارتیتجزیه و تحلیل شبکه ceRNA با توالی یابی مشترک mRNA، lncRNA، circRNA و miRNA و با یک گردش کار بیوانفورماتیک جامع فعال می شود.
●حاشیه نویسی جامع: ما از چندین پایگاه داده برای حاشیه نویسی عملکردی ژن های بیان شده متفاوت (DEGs) و انجام تجزیه و تحلیل غنی سازی مربوطه استفاده می کنیم و بینش هایی را در مورد فرآیندهای سلولی و مولکولی زیربنایی پاسخ رونوشت ارائه می دهیم.
●تخصص گسترده: با سابقه بستن موفقیت آمیز بیش از 2000 پروژه رونویسی کامل در حوزه های مختلف تحقیقاتی، تیم ما تجربه زیادی را برای هر پروژه به ارمغان می آورد.
●کنترل کیفیت دقیق: ما نقاط کنترل اصلی را در تمام مراحل، از آماده سازی نمونه و کتابخانه گرفته تا توالی یابی و بیوانفورماتیک پیاده سازی می کنیم.این نظارت دقیق، ارائه نتایج با کیفیت بالا را تضمین می کند.
● حاشیه نویسی جامع: ما از چندین پایگاه داده برای حاشیه نویسی عملکردی ژن های بیان شده متفاوت (DEGs) و انجام تجزیه و تحلیل غنی سازی مربوطه استفاده می کنیم و بینش هایی را در مورد فرآیندهای سلولی و مولکولی زیربنایی پاسخ رونوشت ارائه می دهیم.
●پشتیبانی پس از فروش: تعهد ما فراتر از اتمام پروژه با یک دوره خدمات پس از فروش 3 ماهه است.در طول این مدت، ما پیگیری پروژه، کمک عیب‌یابی و جلسات پرسش و پاسخ را برای پاسخگویی به هرگونه سؤال مرتبط با نتایج ارائه می‌دهیم.
نمونه مورد نیاز و تحویل
| کتابخانه | استراتژی توالی | داده ها توصیه می شود | کنترل کیفیت |
| rRNA تخلیه شده است | ایلومینا PE150 | 16 گیگابایت | Q30≥85% |
| اندازه انتخاب شده است | ایلومینا SE50 | 10-20 میلیون خوانده شده |
نمونه مورد نیاز:
نوکلئوتیدها:
| Conc.(ng/μl) | مقدار (μg) | خلوص | تمامیت |
| ≥ 100 | ≥ 1 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 آلودگی پروتئین یا DNA محدود یا بدون آلودگی روی ژل نشان داده شده است. | گیاهان: RIN≥6.5 حیوان: RIN≥7.0 5.0≥28S/18S≥1.0; ارتفاع پایه محدود یا بدون ارتفاع |
تحویل نمونه توصیه شده
ظرف:
لوله سانتریفیوژ 2 میلی لیتری (فیل قلع توصیه نمی شود)
برچسب زدن نمونه: گروه + تکرار به عنوان مثال A1، A2، A3.B1، B2، B3...
حمل و نقل:
1. یخ خشک: نمونه ها باید در کیسه های بسته بندی شده و در یخ خشک دفن شوند.
لوله های پایدار RNA: نمونه های RNA را می توان در لوله تثبیت کننده RNA (به عنوان مثال RNAstable®) خشک کرد و در دمای اتاق حمل کرد.
جریان کار خدمات
طراحی آزمایش
تحویل نمونه
استخراج RNA
ساخت کتابخانه
ترتیب دهی
تحلیل داده ها
خدمات پس از فروش
بیوانفورماتیک
مروری بر بیان RNA
ژن های بیان شده متفاوت
تجزیه و تحلیل ceRNA
miRNAهای با بیان متفاوت و RNAهای مرتبط
پیشرفت‌های تحقیقاتی را که توسط خدمات توالی‌یابی کل رونویسی BMKGene تسهیل شده است، از طریق مجموعه‌ای از انتشارات بررسی کنید.
دای، ی و همکاران(2022) "پروفایل های بیان جامع mRNA ها، lncRNA ها و miRNA ها در بیماری کشین بک شناسایی شده توسط توالی یابی RNA"، Molecular Omics، 18(2)، صفحات 154-166.doi: 10.1039/D1MO00370D.
لیو، نان و همکاران.(2022) "تجزیه و تحلیل رونوشت های تمام طول مقاومت به سرما Apis cerana در کوه چانگ بای در طول دوره زمستان گذرانی."، ژن، 830، صفحات 146503-146503.doi: 10.1016/J.GENE.2022.146503.
وانگ، XJ و همکاران.(2022) "اولویت بندی مبتنی بر ادغام چند Omics شبکه های تنظیم کننده RNA درون زا رقابتی در سرطان ریه سلول کوچک: ویژگی های مولکولی و نامزدهای دارویی"، مرزها در انکولوژی، 12، ص.904865. doi: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al.(2022) "تحلیل یکپارچه پروفایل های بیان lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA بینش های جدیدی را در مورد مکانیسم های بالقوه در پاسخ به نماتدهای گره ریشه در بادام زمینی نشان می دهد"، BMC Genomics، 23(1)، صفحات 1-12.doi: 10.1186/S12864-022-08470-3/FIGURES/7.
یان، ز و همکاران.(2022) "توالی یابی RNA کل رونویسی مکانیسم های مولکولی مرتبط با حفظ کیفیت پس از برداشت در کلم بروکلی توسط تابش LED قرمز را برجسته می کند"، زیست شناسی و فناوری پس از برداشت، 188، ص.111878. doi: 10.1016/J.POSTHARVBIO.2022.111878.
