RNA های کوچک نوعی RNA کوتاه غیر کد کننده با طول متوسط 18-30 nt هستند که شامل miRNA، siRNA و piRNA می شود.گزارش شده است که این RNA های کوچک به طور گسترده در فرآیندهای بیولوژیکی مختلف مانند تخریب mRNA، مهار ترجمه، تشکیل هتروکروماتین و غیره دخیل هستند. پلت فرم تجزیه و تحلیل توالی متشکل از تجزیه و تحلیل استاندارد و داده کاوی پیشرفته است.بر اساس داده های RNA-seq، تجزیه و تحلیل استاندارد می تواند به شناسایی و پیش بینی miRNA، پیش بینی ژن هدف miRNA، حاشیه نویسی و تجزیه و تحلیل بیان دست یابد.تجزیه و تحلیل پیشرفته امکان جستجو و استخراج miRNA سفارشی، تولید نمودار Venn، miRNA و ساخت شبکه ژن هدف را فراهم می کند.
