BMKCloud Log in
条形banner-03

محصولات

تعیین توالی RNA پروکاریوتی

توالی یابی RNA پروکاریوتی از توالی یابی نسل بعدی (NGS) برای آشکار کردن حضور و کمیت RNA در یک لحظه معین، با تجزیه و تحلیل رونوشت سلولی در حال تغییر استفاده می کند.توالی یابی RNA پروکاریوتی شرکت ما، به طور خاص پروکاریوت هایی با ژنوم مرجع را هدف قرار می دهد، که پروفایل رونویسی، تجزیه و تحلیل ساختار ژن، و غیره را در اختیار شما قرار می دهد. این به طور گسترده در تحقیقات علوم پایه، تحقیق و توسعه داروها و موارد دیگر استفاده شده است.

پلتفرم: پلتفرم Illumina NovaSeq


جزئیات خدمات

مشخصات خدمات

پلت فرم: پلت فرم Illumina NovaSeq، PE150

نوع کتابخانه: کتابخانه cDNA درج 350bp (بستگی به توزیع اوج دارد)

استراتژی توالی: Paired-End 150bp

مقدار داده پیشنهادی: 2 گیگابایت داده خام/نمونه

بیوانفورماتیک

(1) کنترل کیفیت داده توالی: توزیع نوکلئوتید، توزیع کیفیت پایه، ارزیابی نسبت rRNA.

(2) تجزیه و تحلیل تراز توالی: آمار نتیجه تراز، اشباع توالی، پوشش توالی.

(3) حاشیه نویسی ژنوم مرجع (NR، Swiss-Prot، Pfam، COG، GO، KEGG).

(4) تجزیه و تحلیل بیان: توزیع بیان (با دو یا چند نمونه)، تجزیه و تحلیل بیان بین نمونه ها (تحلیل ون، تجزیه و تحلیل همبستگی، تجزیه و تحلیل PCA).

(5) تجزیه و تحلیل بیان دیفرانسیل (با دو یا چند نمونه)؛

(6) تجزیه و تحلیل مجموعه ژن: تجزیه و تحلیل ون، تجزیه و تحلیل خوشه، تجزیه و تحلیل حاشیه نویسی تابع (COG، GO، KEGG)، تجزیه و تحلیل غنی سازی تابع (GO، KEGG)، نمودار غنی سازی تابع، تجزیه و تحلیل Ipath.

(7) تجزیه و تحلیل sRNA: پیش‌بینی sRNA، حاشیه‌نویسی sRNA (Blast، sRNAMap، sRNATarBase، SIPHT، Rfam)، پیش‌بینی ساختار ثانویه sRNA، پیش‌بینی ژن هدف sRNA.

(8) تجزیه و تحلیل ساختار رونوشت: تجزیه و تحلیل اپرون، پیش‌بینی مکان‌های شروع و پایان رونویسی، حاشیه‌نویسی و تجزیه و تحلیل UTR، پیش‌بینی توالی پروموتر، تجزیه و تحلیل SNP/InDel (حاشیه‌نویسی SNP/InDel، توزیع منطقه‌ای SNP/InDel، آمار SNP).

جریان کار خدمات

تحویل نمونه

تحویل نمونه

آماده سازی کتابخانه

ساخت کتابخانه

ترتیب دهی

ترتیب دهی

تحلیل داده ها

تحلیل داده ها

خدمات پس از فروش

خدمات پس از فروش


  • قبلی:
  • بعد:

  • یک نقل قول دریافت کنید

    پیام خود را اینجا بنویسید و برای ما ارسال کنید

    پیام خود را برای ما ارسال کنید: