-
توالی متاژنومیک -NGS
متاژنوم به مجموعه ای از کل مواد ژنتیکی یک جامعه مختلط از موجودات، مانند متاژنوم محیطی، متاژنوم انسانی و غیره اشاره دارد که حاوی ژنوم های میکروارگانیسم های قابل کشت و غیرقابل کشت است.توالی‌یابی متاژنومیک ابزار مولکولی است که برای تجزیه و تحلیل مواد ژنومی مخلوط استخراج‌شده از نمونه‌های محیطی استفاده می‌شود که اطلاعات دقیقی در مورد تنوع و فراوانی گونه‌ها، ساختار جمعیت، رابطه فیلوژنتیکی، ژن‌های عملکردی و شبکه همبستگی با عوامل محیطی ارائه می‌دهد.
سکو:پلتفرم Illumina NovaSeq
-
متاژنومیک توالی یابی - نانوحفره
متاژنومیکس یک ابزار مولکولی است که برای تجزیه و تحلیل مواد ژنومی مخلوط استخراج شده از نمونه های محیطی استفاده می شود که اطلاعات دقیقی در مورد تنوع و فراوانی گونه ها، ساختار جمعیت، رابطه فیلوژنتیکی، ژن های عملکردی و شبکه همبستگی با عوامل محیطی و غیره ارائه می دهد. پلتفرم های توالی یابی نانوحفره اخیراً معرفی شده است. به مطالعات متاژنومیکعملکرد فوق العاده آن در طول خواندن تا حد زیادی تجزیه و تحلیل متاژنومی پایین جریان، به ویژه مونتاژ متاژنوم را افزایش داد.مطالعه متاژنومی مبتنی بر نانوحفره با بهره‌گیری از مزایای طول خواندن، می‌تواند به مونتاژ پیوسته‌تری در مقایسه با متاژنومیکس شاتگان دست یابد.منتشر شده است که متاژنومیکس مبتنی بر نانوپور با موفقیت ژنوم های باکتریایی کامل و بسته را از میکروبیوم ها تولید کرد (Moss, EL, et. al.,بیوتکنولوژی طبیعت، 2020)
سکو:نانوپور PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
زیرواحد روی 16S و 18S rRNA حاوی هر دو ناحیه بسیار حفاظت شده و فوق متغیر یک اثر انگشت مولکولی عالی برای شناسایی موجودات پروکاریوتی و یوکاریوتی است.با بهره گیری از توالی یابی، این آمپلیکون ها را می توان بر اساس قسمت های حفاظت شده هدف قرار داد و مناطق بیش از حد متغیر را می توان به طور کامل برای شناسایی میکروبی مشخص کرد که به مطالعات مربوط به تجزیه و تحلیل تنوع میکروبی، طبقه بندی، فیلوژنی و غیره کمک می کند. تک مولکولی بلادرنگ (SMRT) ) توالی پلت فرم PacBio به دست آوردن خوانش های طولانی بسیار دقیق را امکان پذیر می کند، که می تواند آمپلیکون های تمام طول (تقریباً 1.5 کیلوبایت) را پوشش دهد.نمای گسترده میدان ژنتیکی وضوح در حاشیه نویسی گونه ها را در جامعه باکتری ها یا قارچ ها افزایش داد.
سکو:PacBio Sequel II
-
توالی آمپلیکون 16S/18S/ITS-NGS
هدف توالی‌یابی آمپلیکون 16S/18S/ITS آشکار کردن فیلوژنی، طبقه‌بندی، و فراوانی گونه‌ها در یک جامعه میکروبی با بررسی محصولات PCR نشانگرهای ژنتیکی خانه‌داری است که شامل بخش‌های بسیار متغییر و بسیار متغیر است.معرفی این اثر انگشت مولکولی کامل توسط Woeses و همکاران (1977) پروفایل میکروبیوم بدون جداسازی را تقویت می کند.تعیین توالی 16S (باکتری)، 18S (قارچ) و فاصله‌گذار رونویسی شده داخلی (ITS، قارچ) امکان شناسایی گونه‌های فراوان و همچنین گونه‌های نادر و ناشناس را می‌دهد.این فناوری به یک ابزار پرکاربرد و اصلی در شناسایی ترکیبات میکروبی متمایز در محیط های مختلف مانند دهان انسان، روده، مدفوع و غیره تبدیل شده است.
سکو:پلتفرم Illumina NovaSeq
-
توالی یابی مجدد کل ژنوم باکتریایی و قارچی
توالی‌یابی مجدد کل ژنوم باکتری‌ها و قارچ‌ها ابزاری حیاتی برای تکمیل ژنوم باکتری‌ها و قارچ‌های شناخته‌شده، و همچنین مقایسه ژنوم‌های متعدد یا نقشه‌برداری از ژنوم ارگانیسم‌های جدید است.تعیین توالی کل ژنوم باکتری ها و قارچ ها به منظور تولید ژنوم های مرجع دقیق، انجام شناسایی میکروبی و سایر مطالعات مقایسه ای ژنوم از اهمیت بالایی برخوردار است.
پلتفرم: پلتفرم Illumina NovaSeq
-
توالی یابی متاترانسکریپتوم
توالی‌یابی متاترانسکیپتوم بیان ژن میکروب‌ها (هم یوکاریوت‌ها و هم پروکاریوت‌ها) را در محیط‌های طبیعی (مانند خاک، آب، دریا، مدفوع و روده) شناسایی می‌کند. به طور خاص، این خدمات به شما امکان می‌دهد پروفایل بیان ژن کل جوامع پیچیده میکروبی، تجزیه و تحلیل طبقه‌بندی را به دست آورید. از گونه‌ها، تجزیه و تحلیل غنی‌سازی عملکردی ژن‌های با بیان متفاوت، و موارد دیگر.
پلتفرم: پلتفرم Illumina NovaSeq
-
ژنوم قارچ
Biomarker Technologies بررسی ژنوم، ژنوم ریز و ژنوم کامل قارچ را بسته به هدف تحقیقاتی خاص ارائه می دهد.توالی یابی ژنوم، مونتاژ و حاشیه نویسی عملکردی را می توان با ترکیب توالی یابی نسل بعدی + توالی یابی نسل سوم برای دستیابی به مونتاژ ژنوم در سطح بالا به دست آورد.فناوری Hi-C همچنین می تواند برای تسهیل مونتاژ ژنوم در سطح کروموزوم استفاده شود.
سکو:PacBio Sequel II
نانوپور PromethION P48
پلتفرم Illumina NovaSeq
-
ژنوم کامل باکتری
Biomarker Technologies خدمات توالی یابی در ساخت ژنوم کامل باکتری ها با فاصله صفر ارائه می دهد.گردش کار اصلی ساخت ژنوم کامل باکتری ها شامل توالی یابی نسل سوم، مونتاژ، حاشیه نویسی عملکردی و تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک پیشرفته است که اهداف تحقیقاتی خاص را برآورده می کند.یک پروفایل جامع تر از ژنوم باکتری ها آشکارسازی مکانیسم های اساسی فرآیندهای بیولوژیکی آنها را تقویت می کند، که می تواند مرجع ارزشمندی برای تحقیقات ژنومی در گونه های یوکاریوتی بالاتر باشد.
سکو:پلتفرم نانوپور PromethION P48 + Illumina NovaSeq
PacBio Sequel II
