-
تعیین توالی ایمونوپسیتاسیون کروماتین (ChIP-seq)
ChIP-Seq پروفایل ژنومی اهداف DNA را برای اصلاح هیستون، فاکتورهای رونویسی و سایر پروتئین های مرتبط با DNA فراهم می کند.این ترکیبی از انتخاب پذیری ایمونو رسوب کروماتین (ChIP) برای بازیابی کمپلکس های پروتئین-DNA خاص، با قدرت توالی یابی نسل بعدی (NGS) برای توالی یابی DNA بازیابی شده با توان عملیاتی بالا.علاوه بر این، از آنجایی که کمپلکس‌های پروتئین-DNA از سلول‌های زنده بازیابی می‌شوند، مکان‌های اتصال را می‌توان در انواع سلول‌ها و بافت‌های مختلف یا در شرایط مختلف مقایسه کرد.کاربردها از تنظیم رونویسی گرفته تا مسیرهای رشدی تا مکانیسم های بیماری و فراتر از آن.
پلتفرم: پلتفرم Illumina NovaSeq
-
توالی یابی بی سولفیت کل ژنوم
متیلاسیون DNA در موقعیت پنجم در سیتوزین (5-mC) تأثیر اساسی بر بیان ژن و فعالیت سلولی دارد.الگوهای متیلاسیون غیرطبیعی با شرایط و بیماری های متعددی مانند سرطان مرتبط است.WGBS به استاندارد طلایی برای مطالعه متیلاسیون در سطح ژنوم در وضوح پایه تبدیل شده است.
پلتفرم: پلتفرم Illumina NovaSeq
-
سنجش کروماتین قابل دسترسی به ترانسپوزاز با توالی یابی بالا (ATAC-seq)
ATAC-seq یک روش توالی یابی با توان بالا برای تجزیه و تحلیل دسترسی کروماتین در کل ژنوم است که برای کنترل جهانی اپی ژنتیکی بیان ژن مهم است.آداپتورهای توالی یابی توسط ترانسپوزاز Tn5 بیش فعال در نواحی کروماتین باز وارد می شوند.پس از تقویت PCR، یک کتابخانه توالی یابی ساخته می شود.تمام نواحی کروماتین باز را می توان تحت یک شرایط فضا-زمانی خاص به دست آورد، نه تنها محدود به محل های اتصال یک فاکتور رونویسی، یا یک ناحیه خاص اصلاح شده هیستون.
-
توالی یابی بی سولفیت با نمایندگی کاهش یافته (RRBS)
تحقیقات متیلاسیون DNA همیشه یک موضوع داغ در تحقیقات بیماری بوده است و ارتباط نزدیکی با بیان ژن و صفات فنوتیپی دارد.RRBS یک روش دقیق، کارآمد و اقتصادی برای تحقیقات متیلاسیون DNA است.غنی سازی نواحی پروموتر و جزیره CpG توسط برش آنزیمی (Msp I)، همراه با توالی یابی بی سولفیت، تشخیص متیلاسیون DNA با وضوح بالا را فراهم می کند.
پلتفرم: پلتفرم Illumina NovaSeq
