در حالی که توالی یابی mRNA مبتنی بر NGS به عنوان یک ابزار همه کاره برای تعیین کمیت بیان ژن عمل می کند، اتکای آن به خواندن کوتاه، کارایی آن را در آنالیزهای پیچیده ترانسکریپتومی محدود می کند.از سوی دیگر، توالییابی PacBio (Iso-Seq)، از فناوری خواندن طولانی استفاده میکند و امکان توالییابی رونوشتهای mRNA تمامقد را فراهم میکند.این رویکرد یک کاوش جامع در مورد پیرایش جایگزین، همجوشی ژن و پلی آدنیلاسیون را تسهیل می کند، اگرچه انتخاب اولیه برای کمی سازی بیان ژن نیست.ترکیب 2+3 شکاف بین Illumina و PacBio را با تکیه بر خواندن PacBio HiFi برای شناسایی مجموعه کامل ایزوفرم های رونوشت و توالی NGS برای تعیین کمیت ایزوفرم های مشابه پر می کند.
پلتفرمها: PacBio Sequel II و Illumina NovaSeq