محصولات

توالی یابی ژنوم کل گیاه/حیوان

توالی‌یابی مجدد کل ژنوم، که به عنوان WGS نیز شناخته می‌شود، امکان آشکارسازی جهش‌های رایج و نادر را در کل ژنوم از جمله پلی‌مورفیسم تک نوکلئوتیدی (SNP)، حذف درج (InDel)، تنوع ساختار (SV) و تنوع تعداد کپی (CNV) فراهم می‌کند. ).SV ها نسبت به SNP ها بخش بزرگ تری از پایه تغییرات را تشکیل می دهند و تأثیر بیشتری روی ژنوم دارند که تأثیر قابل توجهی بر موجودات زنده دارد.توالی خوانی طولانی امکان شناسایی دقیق تر قطعات بزرگ و تغییرات پیچیده را فراهم می کند، زیرا خواندن طولانی، عبور کروموزومی از مناطق پیچیده مانند تکرارهای پشت سر هم، مناطق غنی از GC/AT و مناطق بیش از حد متغیر را بسیار آسان تر می کند.

پلتفرم: Illumina، PacBio، Nanopore

با ما تماس بگیرید

جزئیات خدمات

نتیجه نمایشی

انتشارات ویژه

1. مزایای خدمات

تجربه گسترده در تعیین توالی ژنوم برای بیش از 1000 گونه.

بیش از 800 مورد منتشر شده با ضریب تأثیر تجمعی بیش از 4000.

تجزیه و تحلیل جامع بیوانفورماتیک در فراخوانی تغییرات و تجزیه و تحلیل تابع.

2. مشخصات خدمات

سکو		کتابخانه	عمق دنباله توصیه شده
ایلومینا		PE 150	برای SNP، تماس InDel ≥ 10x برای SV، CNY تماس ≥ 30x
نانوپور		8 کیلوبایت	برای SV، CNY تماس ≥ 20x
پاکبیو	CCS	15 کیلوبایت	برای تماس SNP، InDel، SV، CNY ≥ 10x

3. نمونه مورد نیاز

سکو		Conc.(ng/μL)	مقدار (ng)	خلوص		ژل آگارز
				OD260/280	OD260/230	1. پاک کردن باند اصلی بدون یا محدودتخریب روی ژل مشاهده شد. 2. آلودگی RNA یا پروتئین وجود ندارد یا محدود است
ایلومینا		≥1	≥30	-	-
نانوپور		≥30	بستگی به بازده داده دارد 10 میکروگرم در سلول	1.7-2.2	≥1.5
پاکبیو	CCS	≥50		1.7-2.2	1.8-2.5

4. تجزیه و تحلیل اطلاعات زیستی

5. جریان کار خدمات

تحویل نمونه

استخراج DNA

ساخت کتابخانه

ترتیب دهی

تحلیل داده ها

تحویل داده ها

قبلی: رونوشت فضایی BMKMANU S1000

بعد: توالی یابی RNA تک هسته ای

1) آمار نقشه برداری ژنوم

جدول 1 آمار نتیجه نقشه برداری

شکل 1 توزیع اندازه درج و پوشش خوانده شده.

2) تشخیص متغیر

شکل 2 آمار و حاشیه نویسی SNP/INDEL/SV در بین نمونه ها

شکل 3 توزیع کل ژنوم واتاسیون ها

3) حاشیه نویسی عملکردی تغییرات

2019	ارتباطات طبیعت	توالی یابی مجدد کل ژنوم منشا Brassica napus و مکان های ژنتیکی دخیل در بهبود آن را نشان می دهد.
2020	PNAS	منشا تکاملی و تاریخچه اهلی شدن ماهی قرمز (Carassius auratus)
2021	مجله بیوتکنولوژی گیاهی	ژنوم مرجع دو گونه جوت کشت شده
2021	مجله بیوتکنولوژی گیاهی	امضاهای ژنومی آلوپلیپلوئید گیاهی و دانه های روغنی Brassicajuncea و جایگاه های ژنتیکی کنترل کننده تجمع گلوکوزینولات ها
2019	گیاه مولکولی	توالی‌یابی مجدد کل ژنوم مجموعه‌ای از کلزا در سراسر جهان، مبنای ژنتیکی واگرایی اکوتیپ آن‌ها را نشان می‌دهد.
2022	تحقیقات باغبانی	تجزیه و تحلیل ارتباط گسترده ژنوم، بینش مولکولی را در مورد تغییرات طبیعی اندازه دانه هندوانه ارائه می دهد
2021	مجله گیاه شناسی تجربی	مطالعه ارتباط گسترده ژنوم، انواع GhSAD1 را شناسایی می کند که تحمل سرما را در پنبه ایجاد می کند.
2021	مجله گیاه شناسی تجربی	مطالعه ارتباط گسترده ژنوم و مقایسه رونویسی QTL جدید و ژن‌های کاندید را نشان می‌دهد که اندازه گلبرگ را در کلزا کنترل می‌کنند.