میکروبی
سازگاری و تثبیت باکتری با بیوچار باعث بهبود تجزیه تبوکونازول، ترکیب و عملکرد میکروبیوم خاک شد.
توالی آمپلیکون 16S تمام قد |PacBio HiFi |تنوع آلفا |تنوع بتا
در این مطالعه، توالی یابی آمپلیکون 16S با طول کامل توسط PacBio و تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک توسط Biomarker Technologies ارائه شد.
نکات برجسته
بیوچار بی حرکت باکتری تجزیه کننده تبوکونازول Alcaligenes faecalis WZ-2 بر روی کارایی تجزیه زیستی و تأثیرات آن بر روی خاک آلوده به تبوکونازول در مقایسه با سویه تجزیه کننده آزاد WZ-2 مورد مطالعه قرار گرفت.
1. WZ-2 تثبیت شده با بیوچار، با کاهش نیمه عمر تبوکونازول در خاک از 18.7 روز به 13.3 روز، تخریب کارآمدتری را در تبوکونازول در مقایسه با WZ-2 آزاد نشان داد.
2. WZ-2 تثبیت شده با بیوچار قادر به بازیابی فعالیت های آنزیم میکروبی بومی خاک، از جمله اوره آز، دهیدروژناز و اینورتاز و غیره بود.
3. مشخصات میکروبی در خاک تیمار شده با بیوچار بی‌حرکت شده با WZ-2 که توسط توالی 16S تمام طول تعیین شده است، قویاً تأیید می‌کند که این سیستم می‌تواند سلامت خاک را با بهبود ساختار جامعه باکتریایی تحت آلودگی تبوکونازول بازگرداند.
تجربه (مرتبط با توالی)
گروه بندی: CK: خاک طبیعی;T: خاک حاوی تبوکونازول.S: خاک حاوی تبوکونازول با سویه آزاد WZ-2.قبل از میلاد: تبوکونازول حاوی خاک با بیوچار بود.BCS: تبوکونازول حاوی خاک با بیوچار بی حرکت WZ-2.
نمونه برداری: استخراج DNA کل خاک با پرایمرهای 16S rDNA تکثیر شد
27F (5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3') و 1492R (5'-GGTTACCTTGTTACGA)،پشیمان کننده 16S rDNA تمام قد
پلت فرم توالی: PacBio RS II
استراتژی توالی: CCS HIFI می خواند
تحلیل داده ها:BMKCloudبسترسازی بیوانفورماتیک ماهی قرمز را به یک سیستم مدل ژنتیکی عالی برای فیزیولوژی و تکامل ماهی تبدیل می کند.
نتیجه
ساختار جامعه میکروبی خاک با تعیین توالی 16S rDNA تعیین شد.غنای OTU و شاخص تنوع آلفا، از جمله شاخص‌های Chao1، Ace، Shannon و Simpson برای آشکار کردن تنوع گونه‌ای در هر سیستم مورد ارزیابی قرار گرفت.پس از 60 روز جوجه کشی، همه شاخص ها روند مشابهی را نشان دادند، یعنی تبوکونازول می تواند باعث کاهش غنای گونه ای و تنوع در خاک شود.با این حال، با افزودن سویه WZ-2، جامعه باکتری های خاک تا حدی از نظر غنا و تنوع بازیابی شد.تفاوت محدودی بین BC، BCS و CK مشاهده شد که نشان می‌دهد بیوچار و WZ-2 بی‌حرکت شده با بیوچار می‌توانند به طور موثر سلامت بیولوژیکی خاک را بازیابی کنند.
در این مطالعه برای نشان دادن تنوع بتا در بین گروه‌ها از روش گروه‌های زوج وزنی با میانگین حسابی (UPGMA) استفاده شد.همانطور که در شکل زیر نشان داده شده است، BC، BSC و CK در مقایسه با گروه T و S الگوی مشابه بیشتری از ترکیب میکروبی داشتند، که بیشتر نشان داد که معرفی بیوچار در تصفیه زیستی خاک آلوده به تبوکونازول می تواند تا حد زیادی بازیابی جامعه میکروبی در خاک را تسهیل کند.
شکل.خوشه بندی UPGMA جامعه باکتریایی در سطح شاخه تحت تیمارهای مختلف
ارجاع
سان، تانگ و همکارانسازگاری و تثبیت باکتری با بیوچار باعث بهبود تخریب تبوکونازول، ترکیب میکروبیوم خاک و عملکرد آن شد.مجله مواد خطرناک398 (2020): 122941.
اخبار و نکات مهم هدف آن به اشتراک گذاری آخرین موارد موفق با Biomarker Technologies، ثبت دستاوردهای علمی جدید و همچنین تکنیک های برجسته به کار رفته در طول مطالعه است.
زمان ارسال: ژانویه-08-2022