ژنوم
مونتاژ کروموزومی و تجزیه و تحلیل ژنوم محصول زیست توده Miscanthus lutarioriparius
توالی یابی نانوحفره |ایلومینا |سلام C |توالی یابی RNA |فیلوژنی
در این مطالعه، Biomarker Technologies پشتیبانی فنی از توالییابی نانوپور، مونتاژ ژنوم de novo، مونتاژ به کمک Hi-C و غیره ارائه کرد.
خلاصه
میسکانتوسگیاهی چند ساله ریزوماتوز، به دلیل تحمل زیست توده و تنش بالا، پتانسیل زیادی برای تولید انرژی زیستی دارد.ما یک مجموعه در مقیاس کروموزوم ازMiscanthus lutarioripariusژنوم با ترکیب توالییابی نانوپوره آکسفورد و فناوریهای Hi-C.مجموعه 2.07 گیگابایتی 96.64 درصد از ژنوم را پوشش میدهد و مقدار N50 آن 1.71 مگابایت است.توالی های سانترومر و تلومر به ترتیب برای همه 19 کروموزوم و کروموزوم 10 جمع شده اند.منشاء آلوتراپلوئید M. lutarioriparius با استفاده از تکرارهای ماهواره ای سانترومر تایید شده است.ساختار ژنوم تتراپلوئید و چندین بازآرایی کروموزومی نسبت به سورگوم به وضوح نشان داده شده است.ژن های تکراری پشت سر هم ازM. lutarioripariusنه تنها از نظر پاسخ به استرس، بلکه از نظر بیوسنتز دیواره سلولی غنی شده اند.خانواده های ژنی مرتبط با مقاومت در برابر بیماری، بیوسنتز دیواره سلولی و انتقال یون فلزی بسیار گسترش یافته و تکامل یافته اند.گسترش این خانواده ها ممکن است یک پایه ژنومی مهم برای افزایش صفات قابل توجه باشدM. lutarioriparius.
آمار کلیدی مونتاژ ژنوم
شکل.مروری بر مجموعه ژنوم M. lutarioriparius
اخبار و نکات مهم هدف آن به اشتراک گذاری آخرین موارد موفق با Biomarker Technologies، ثبت دستاوردهای علمی جدید و همچنین تکنیک های برجسته به کار رفته در طول مطالعه است.
زمان ارسال: ژانویه-05-2022