BMKGENE خدمات توالی رونویسی فضایی را برای این مطالعه ارائه کرد "STEEL ترسیم با وضوح بالا داده های رونویسی مکانی-زمانی را امکان پذیر می کند" که در Briefings in Bioinformatics منتشر شد.
این مطالعه یک الگوریتم مبتنی بر یادگیری بدون نظارت و چندگانه، خوشهبندی نوع سلول رونویسی فضایی (STEEL) را پیشنهاد کرد که با خوشهبندی مهرههایی که نمایههای بیان ژن بسیار مشابه و فاصله فضایی نزدیک را به شیوه نمودارها نشان میدهند، حوزهها را از رونوشت فضایی شناسایی میکند.
یک ارزیابی جامع از STEEL بر روی مجموعه دادههای رونویسی فضایی از پلتفرم 10X Visium نشان میدهد که نه تنها به وضوح بالایی برای توصیف ساختارهای ظریف مغز موش دست مییابد، بلکه امکان ادغام اسلایدهای بافتی متعدد را به صورت جداگانه در یک بزرگتر تجزیه و تحلیل میکند.
با پیشرفت فناوری رونویسی فضایی، روش ما کاربرد زیادی در شناسایی دامنه و بازسازی اطلس بیان ژن خواهد داشت.
کلیکاینجابرای کسب اطلاعات بیشتر در مورد این مطالعه
زمان ارسال: اکتبر 20-2023