●بستر، زمینه:Illumina NovaSeq 6000، NovaSeq، HiSeq X Ten و BGI-DNB-T7
●حالت های توالی:PE50، PE100، PE150، PE250
●کنترل کیفیت کتابخانه ها قبل از توالی یابی
●توالی تحویل داده و QC:تحویل گزارش QC و دادههای خام در قالب fastq پس از مالتی پلکس کردن و فیلتر کردن قرائتهای Q30.
●تطبیق پذیری خدمات توالی یابی:مشتری ممکن است توالی بر اساس خط، سلول جریان یا مقدار داده را انتخاب کند.
●تطبیق پذیری پلتفرم ها:کتابخانه های DNB را می توان به پلتفرم های Illumina منتقل کرد
●تجربه گسترده در پلتفرم توالی یابی Illumina:با هزاران پروژه بسته با گونه های مختلف.
●تحویل گزارش QC توالی:با معیارهای کیفیت، دقت داده ها و عملکرد کلی پروژه توالی.
●فرآیند توالی یابی بالغ:با مدت زمان کوتاه
●کنترل کیفیت دقیق: ما الزامات سختگیرانه QC را برای تضمین ارائه نتایج با کیفیت بالا اجرا می کنیم.
مقدار داده (X) | غلظت (qPCR/nM) | جلد |
X ≤ 50 گیگابایت | ≥ 2 نانومتر | ≥ 20 میکرولیتر |
50 گیگابایت ≤ X < 100 گیگابایت | ≥ 3 نانومتر | ≥ 20 میکرولیتر |
X ≥ 100 گیگابایت | ≥ 4 نانومتر | ≥ 20 میکرولیتر |
سکو | غلظت (qPCR/nM) | جلد |
HiSeq X Ten | ≥ 2 نانومتر | ≥ 20 میکرولیتر |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 نانومتر | ≥ 25 میکرولیتر |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1.5 نانومتر | ≥ 25 میکرولیتر |
NovaSeq X | ≥ 1.5 نانومتر | ≥ 25 میکرولیتر |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1.5 نانومتر | ≥ 25 میکرولیتر |
علاوه بر غلظت و مقدار کل، الگوی پیک مناسب نیز مورد نیاز است.
گزارشی در مورد کیفیت کتابخانه قبل از توالی یابی، ارزیابی مقدار کتابخانه و تکه تکه شدن ارائه می شود.
جدول 1. آمار مربوط به توالی داده ها.
شناسه نمونه | BMKID | خام می خواند | داده خام (bp) | خواندن های تمیز (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
شکل 1. توزیع کیفیت همراه با خواندن در هر نمونه
شکل 2. توزیع محتوای پایه
شکل 3. توزیع محتویات خوانده شده در داده های توالی