توالی یابی circRNA-Illumina
امکانات
● کاهش rRNA و به دنبال آن آماده سازی کتابخانه جهت دار، امکان توالی یابی داده هایی را که به رشته خاص می باشند، می دهد.
● گردش کار بیوانفورماتیک، پیش بینی circRNA و تعیین کمیت بیان را امکان پذیر می کند
مزایای خدمات
●کتابخانه های جامع RNA:ما از تخلیه rRNA به جای تخلیه خطی RNA در آماده سازی پیش از کتابخانه خود استفاده می کنیم و اطمینان حاصل می کنیم که داده های توالی یابی نه تنها شامل circRNA بلکه mRNA و lncRNA نیز می شود و امکان تجزیه و تحلیل مشترک در این مجموعه داده ها را فراهم می کند.
●تجزیه و تحلیل اختیاری شبکه های رقابتی RNA درون زا (ceRNA).: ارائه بینش عمیق تر در مورد مکانیسم های تنظیم کننده سلولی
●تخصص گسترده: تیم ما با سابقه پردازش بیش از 20000 نمونه در BMK، انواع مختلف نمونه و پروژه های lncRNA، تجربه زیادی را برای هر پروژه به ارمغان می آورد.
●کنترل کیفیت دقیق: ما نقاط کنترل اصلی را در تمام مراحل، از آماده سازی نمونه و کتابخانه گرفته تا توالی یابی و بیوانفورماتیک پیاده سازی می کنیم.این نظارت دقیق، ارائه نتایج با کیفیت بالا را تضمین می کند.
● پشتیبانی پس از فروش: تعهد ما فراتر از اتمام پروژه با یک دوره خدمات پس از فروش 3 ماهه است.در طول این مدت، ما پیگیری پروژه، کمک عیب‌یابی، و جلسات پرسش و پاسخ را برای پاسخگویی به هرگونه سؤال مرتبط با نتایج ارائه می‌دهیم.
نمونه مورد نیاز و تحویل
| کتابخانه | سکو | داده های توصیه شده | QC داده ها |
| پلی A غنی شده است | ایلومینا PE150 | 16-20 گیگابایت | Q30≥85% |
نمونه مورد نیاز:
نوکلئوتیدها:
| Conc.(ng/μl) | مقدار (μg) | خلوص | تمامیت |
| ≥ 100 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 آلودگی پروتئین یا DNA محدود یا بدون آلودگی روی ژل نشان داده شده است. | برای گیاهان: RIN≥6.5; برای حیوانات: RIN≥7.0؛ 5.0≥28S/18S≥1.0; ارتفاع پایه محدود یا بدون ارتفاع |
● گیاهان:
ریشه، ساقه یا گلبرگ: 450 میلی گرم
برگ یا دانه: 300 میلی گرم
میوه: 1.2 گرم
● حیوان:
قلب یا روده: 450 میلی گرم
احشاء یا مغز: 240 میلی گرم
عضله: 600 میلی گرم
استخوان، مو یا پوست: 1.5 گرم
● بندپایان:
حشرات: 9 گرم
سخت پوستان: 450 میلی گرم
● خون کامل:2 لوله
● سلول ها: 106 سلول ها
● سرم و پلاسما: 6 میلی لیتر
تحویل نمونه توصیه شده
ظرف: لوله سانتریفیوژ 2 میلی لیتری (فیل قلع توصیه نمی شود)
برچسب زدن نمونه: گروه + تکرار به عنوان مثال A1، A2، A3.B1، B2، B3...
حمل و نقل:
1. یخ خشک: نمونه ها باید در کیسه های بسته بندی شده و در یخ خشک دفن شوند.
2. لوله های پایدار RNA: نمونه های RNA را می توان در لوله تثبیت کننده RNA (به عنوان مثال RNAstable®) خشک کرد و در دمای اتاق حمل کرد.
جریان کار خدمات
طراحی آزمایش
تحویل نمونه
استخراج RNA
ساخت کتابخانه
ترتیب دهی
تحلیل داده ها
خدمات پس از فروش
بیوانفورماتیک
پیش بینی circRNA: توزیع کروموزومی
circRNAهای با بیان متفاوت - نمودار آتشفشان
circRNAهای بیان شده متفاوت - خوشه بندی سلسله مراتبی
غنی سازی عملکردی ژن های میزبان circRNA
پیشرفت‌های تحقیقاتی تسهیل‌شده توسط سرویس‌های توالی‌یابی circRNA BMKGene را از طریق مجموعه‌ای از انتشارات انتخاب شده کاوش کنید.
وانگ، ایکس و همکاران.(2021) 'CPSF4 تشکیل circRNA و خاموش کردن ژن با واسطه میکروRNA را در سرطان کبد تنظیم می کند'، Oncogene 2021 40:25، 40(25)، صفحات 4338-4351.doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia، K. و همکاران.(2023) "رونوشت پاسخگو به X oo نقش RNA133 دایره ای را در مقاومت به بیماری با تنظیم بیان OsARAB در برنج نشان می دهد"، Phytopathology Research، 5(1)، صفحات 1-14.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FIGURES/6.
Y, H. و همکاران.(2023) 'CPSF3 تعادل رونوشت های دایره ای و خطی را در کارسینوم کبدی تعدیل می کند.doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang، Y. و همکاران.(2023) "ارزیابی جامع circRNA ها در کاردیومیوپاتی سیروتیک قبل و بعد از پیوند کبد"، ایمونوفارماکولوژی بین المللی، 114، ص.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
