Heatmap tiradera bero-mapa marrazteko erabiltzen da, eta horrek iragazi, normalizatu eta matrizearen datuak klusteratu ditzake. Gehienbat lagin ezberdinen arteko gene-adierazpen-maila multzoka aztertzeko erabiltzen da.
Funtzio biologikoak eranstea FASTA fitxategiko sekuentziak datu-basean lerrokatuz, NR, KEGG, COG, SwissProt, TrEMBL, KOG, Pfam barne.
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) antzeko sekuentzia biologikoak dituzten eskualdeak aurkitzeko algoritmo eta programa da.Sekuentzia hauek sekuentzia datu-baseekin alderatzen ditu eta esanahi estatistikoa kalkulatzen du.BLAST sekuentzia motan oinarritutako lau tresna motak osatzen dute: blastn, lastp, blastx eta tblastn.