GENOMA
Miscanthus lutarioriparius genoma biomasa-laborearen kromosoma eskalan muntatzea eta analisia
Nanoporoen sekuentziazioa |Illumina |Kaixo-C |RNA-sekuentziazioa |Filogenesia
Ikerketa honetan, Biomarker Technologies-ek laguntza teknikoa eman zuen Nanoporeen sekuentziazioari, de novo genomaren muntaketari, Hi-C lagundutako muntaketari, etab.
Abstraktua
Miskantoa, landare errizomatoso iraunkorrak, bioenergia ekoizteko potentzial handia du bere biomasa handia eta estresarekiko tolerantziagatik.Kromosoma-eskalako muntaketa baten berri ematen duguMiscanthus lutarioripariusgenoma Oxford Nanopore sekuentziazioa eta Hi-C teknologiak konbinatuz.2,07 Gb-ko muntaiak genomaren % 96,64 estaltzen du, 1,71 Mb-ko N50 kontigarekin.Zentromero eta telomero sekuentziak 19 kromosoma eta 10 kromosoma guztietarako muntatzen dira, hurrenez hurren.M. lutarioriparius-aren jatorri alotetraploidea satelite zentromerikoaren errepikapenen bidez baieztatu da.Tetraploidearen genomaren egitura eta sorgoarekiko hainbat berrantolaketa kromosomiko argi frogatuta daude.Bikoiztutako gene tandemakM. lutarioripariusfuntzionalki aberasten dira estresaren erantzunarekin lotutako terminoetan ez ezik, zelulen hormaren biosintesia ere.Gaixotasunen erresistentziari, horma zelularren biosintesiari eta ioi metalikoen garraioari lotutako gene-familiak asko hedatu eta eboluzionatu dira.Familia horien hedapena oinarri genomiko garrantzitsua izan daiteke ezaugarri nabarmenak hobetzekoM. lutarioriparius.
Genomaren muntaketaren funtsezko estatistikak
Irudia.M. lutarioriparius genomaren muntaketaren ikuspegi orokorra
Albisteak eta Nabarmenak Biomarker Technologiesekin azken kasu arrakastatsuak partekatzea du helburu, lorpen zientifiko berriak eta ikerketan zehar aplikatutako teknika nabarmenak jasoz.
Argitalpenaren ordua: 2022-05-05