Genoma osoko elkarte-azterketak (GWAS) ezaugarri zehatzekin (fenotipo) lotzen diren aldaera genetikoak (genotipoa) identifikatzea du helburu.GWA ikerketek marka genetikoak gizabanako kopuru handien genoma osoa zeharkatzen dute eta genotipo-fenotipo-elkarteak aurreikusten dituzte populazio mailan analisi estatistikoaren bidez.Genoma osoaren birsekuentziazioak aldaera genetiko guztiak aurki ditzake.Datu fenotipikoekin batera, GWAS prozesatu daiteke fenotipoarekin erlazionatutako SNP, QTL eta gene hautagaiak identifikatzeko, eta horrek biziki babesten du animalien/landareen hazkuntza modernoa.SLAF norberak garatutako genoma sinplifikatutako sekuentziazio estrategia bat da, eta genoma osoan banatutako markatzaileak, SNP, aurkitzen ditu.SNP hauek, markatzaile genetiko molekular gisa, prozesatu daitezke ezaugarri zuzenduak dituzten asoziazio-azterketetarako.Kostu-eraginkorra den estrategia bat da, lotutako ezaugarri konplexuak aldakuntza genetikoak identifikatzeko.
