Produktuak

Genoma osoko elkarteen analisia

Genoma osoko elkarte-azterketak (GWAS) ezaugarri zehatzekin (fenotipo) lotzen diren aldaera genetikoak (genotipoa) identifikatzea du helburu.GWAS ikerketak marka genetikoak gizabanako kopuru handien genoma osoa zeharkatzen du eta genotipo-fenotipo elkarteak aurreikusten ditu populazio mailan analisi estatistikoaren bidez.Animalien edo landareen ezaugarri konplexuetan giza gaixotasunen eta gene-meatzaritza funtzionalaren ikerketan asko aplikatu da.

Jarri gurekin harremanetan

Zerbitzuaren xehetasunak

Demo Emaitza

Argitalpen nabarmendua

1.Zerbitzuaren abantailak

● Proiektu-kasu ugari: 2009an sortu zenetik, BMKGENEk ehunka espezie proiektu burutu ditu populazio GWAS ikerketan, ikertzaileei lagundu die 100 artikulu baino gehiago argitaratzen eta metatutako eragin-faktorea 500era iritsi da.
● Analista profesionalak.
● Analisi-ziklo laburra.
● Datuen meatzaritza zehatza.

2. Zerbitzuaren zehaztapenak

Mota	Biztanleria Eskala	Sekuentziazio estrategia eta sakontasuna
SLAF-GWAS	Lagin-zenbakia ≥200	Genomaren tamaina < 400M, erref-genomarekin, WGS gomendatzen da
		Genomaren tamaina ≤ 1G, 100K Etiketak eta 10X
		1G ≤ Genomaren tamaina ≤ 2G, 200K etiketak eta 10X
		Genomaren tamaina > 2G, 300K etiketak eta 10X
WGS-GWAS	Lagin-zenbakia ≥200	10X lagin bakoitzeko

3. Materialen hautaketa

Barietate, subespezie, lurralde-arraza/genebanku/familia mistoak/basa-baliabide desberdinak

Barietate desberdinak, azpiespezieak, lurralde-arraza

Anai erdi-familia/arreba-familia/basa-baliabideak

4. Bioinformazioaren analisia

● Genoma osoko elkarteen azterketa
● SNP esanguratsuen azterketa eta baheketa
● Gene hautagaiaren oharpen funtzionala

5. Zerbitzu-lan-fluxua

Esperimentuen diseinua

Laginaren entrega

RNA erauzketa

Liburutegiaren eraikuntza

Sekuentziazioa

Datuen azterketa

Salmenta osteko zerbitzuak

Aurrekoa: Nukleo bakarreko RNAren sekuentziazioa

Hurrengoa:

a.QC fenotipoa

Maiztasun banaketaren histograma

Fenotipoen estatistikak

b.Elkarteen analisia (eredua: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)

QQ lursaila

Manhattan lursaila

Urtea	Aldizkaria	IF	Izenburua
2022	NC	17.69	Paeonia ostii zuhaitz-peoniaren giga-kromosomaren eta giga-genomaren oinarri genomikoa
2015	NP	7.43	Etxeko aztarnek agronomiko garrantzia duten eskualde genomikoak ainguratzen dituzte sojetan
2018	MP	9.32	Koltza-hazien bilduma baten mundu osoko genoma birsekuentziatzeak euren ekotipoen dibergentziaren oinarri genetikoak agerian uzten ditu
2022	HR	7.29	Genoma osoko asoziazio-analisiak sandia-haziaren tamainaren aldakuntza naturalari buruzko ikuspegi molekularra eskaintzen du