● Sekuentziazio-estrategia anitz eskuragarri ikerketa-helburu desberdinetarako
● Esperientzia handia onddoen genomaren muntaketan 10.000 pene osoko genoma baino gehiago muntatuta.
● Salmenta osteko laguntza teknikoko talde profesionala, ikerketa-behar zehatzagoak betetzen dituena.
Zerbitzua | Sekuentziazio Estrategia | Kalitatea bermatuta | Gutxi gorabeherako epea |
Onddoen mapa fina | Illumina 50X+Nanopore 100X | Konting N50≥2 Mb | 35 lanegun |
PacBio HiFi 30X | |||
Onddoen pene-mapa osoa | Illumina 50X+Nanopore 100X (Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | Kromosomaren ainguratze-erlazioa >% 90 | 45 lanegun |
● Datu gordinak kalitate kontrola
● Genomaren muntaia
● Genomaren osagaien analisia
● Gene-funtzioaren oharpena
● Analisi genomiko konparatiboa
Izan ereDNAren laburpenak:
Lagin mota | Zenbatekoa | Kontzentrazioa | Garbitasuna |
DNAren laburpenak | > 1,2 μg | > 20 ng/μl | OD260/280= 1,6-2,5 |
Ehun laginetarako:
Lagin mota | Gomendatutako laginaren tratamendua | Laginak biltegiratzea eta bidaltzea |
Onddo zelulabakarra | Behatu legamia mikroskopioan eta bildu bere fase esponentzialean Transferitu kultura (gutxi gorabehera 3-4.5e9 zelula dituena) 1,5 edo 2 ml-ko eppendorf batera.(Jarraitu izotzean) Zentrifugatu hodia 1 min 14000 g-tan bakterioak biltzeko eta gainnatzailea kontu handiz kendu Hodia itxi eta bakterioak izoztu nitrogeno likidoan gutxienez 1-3 orduz.Gorde hodia -80 ℃ hozkailuan. | Izoztu laginak nitrogeno likidoan 3-4 orduz eta gorde nitrogeno likidoan edo -80 gradu epe luzerako erreserbarako.Laginak izotz lehorrekin bidaltzea beharrezkoa da. |
Makro Onddoa | Hazkuntza aktiboko fasean dagoen ehuna gomendatzen da. Garbitu ehuna endotoxinarik gabeko urarekin, gero %70 ethonal. Gorde lagina krio-hodietan. |
1.Onddoen osagai genomikoei buruzko zirkuko diagrama
2.Genomiko analisi konparatiboa: Zuhaitz filogenetikoa