Produktuak

ARNm eukariotoen sekuentziazioa-Illumina

ARNm eukariotikoen sekuentziazioa-Illumina Irudi Nabarmendu

mRNA sekuentziatzeak baldintza zehatzetan zeluletatik transkriptutako mRNA guztien profila ahalbidetzen du.Zenbait prozesu biologikoren gene-adierazpen-profila, gene-egiturak eta mekanismo molekularrak ezagutarazteko teknologia indartsua da.Orain arte, mRNAren sekuentziazioa oso erabilia izan da oinarrizko ikerketan, diagnostiko klinikoan, sendagaien garapenean, etab.

Plataforma: Illumina NovaSeq Plataforma

Jarri gurekin harremanetan

Zerbitzuaren xehetasunak

Bioinformatika

Demo emaitzak

Abantailak

● Esperientzia handikoa: BMKn 200.000 lagin baino gehiago prozesatu dira hainbat lagin mota biltzen dituztenak, besteak beste, zelula-kultura, ehuna, gorputz-likidoa, etab. eta 7.000 mRNA-Seq proiektu baino gehiago itxi dira hainbat ikerketa-eremu hartzen dituztenak.

● Kalitate-kontrol-sistema zorrotza: oinarrizko kalitate-kontroleko puntuak laginak prestatzea, liburutegia prestatzea, sekuentziazioa eta bioinformatika barne hartzen dituzten urrats guztietan jarraipen zorrotzean daude kalitate handiko emaitzak emateko.

● Datu-base anitz eskuragarri funtzioen oharrak eta aberaste-azterketak egiteko, ikerketa-helburu desberdinak betetzeko.

● Salmenta osteko zerbitzuak: salmenta osteko zerbitzuak 3 hilabeterako balio du proiektua amaitzean, proiektuen jarraipena, arazoak konpontzea, emaitzen galderak eta abar barne.

Lagin-baldintzak eta entrega

Liburutegia	Sekuentziazio estrategia	Gomendatutako datuak	Kalitate kontrola
Poly A aberastua	Illumina PE150	6 Gb	Q30≥85%

Lagin-baldintzak:

Nukleotidoak:

Konk. (ng/μl)

Kantitatea (μg)

Garbitasuna

Osotasuna

≥ 20

≥ 0,5

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Gelan agertzen da proteina edo DNA kutsadura mugatua edo ez.

Landareetarako: RIN≥6,5;

Animalientzat: RIN≥7,0;

5.0≥28S/18S≥1.0;

Oinarrizko kota mugatua edo ez

Ehuna: Pisua (lehorra):≥1 g
*5 mg baino txikiagoak diren ehunetarako, izoztutako (nitrogeno likidoan) ehun lagina bidaltzea gomendatzen dugu.

Zelula esekidura:Gelaxka kopurua = 3×10⁶- 1×10⁷
* Izoztutako zelula lisatua bidaltzea gomendatzen dugu.Gelaxka hori 5×105 baino txikiagoa bada.

Odol laginak:Bolumena ≥1 ml

Mikroorganismoa:Masa ≥ 1 g

Laginaren entrega gomendatua

Ontzia: 2 ml zentrifugatzaile-hodia (ez da gomendagarria eztainu-papera)

Laginaren etiketatzea: Taldea+erreplika, adibidez, A1, A2, A3;B1, B2, B3....

Bidalketa:

Izotz lehorra: laginak poltsetan sartu eta izotz lehorrean lurperatu behar dira.
RNAstable hodiak: RNA laginak RNA egonkortzeko hodi batean lehortu daitezke (adibidez, RNAstable®) eta giro-tenperaturan bidal daitezke.